RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 Q8NAQ8 132 aa3.4□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 PDZD2O15018 2839 aa3.4□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GVY2 172 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GUV1 79 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 FAM104AQ969W3 186 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 CD164Q04900 197 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 NF1P21359 2839 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 F8WDY8 70 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 YPEL4Q96NS1 127 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 COL12A1Q99715 3063 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 ITPR1Q14643 2758 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 ZZEF1O43149 2961 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GVX0 72 aa3.37□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 LAMA1P25391 3075 aa3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 FRYLO94915 3013 aa3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 APCP25054 2843 aa3.36□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 COL4A1P02462 1669 aa3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 Q1T7F1 81 aa3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 A0A0A0MQY5 61 aa3.35□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.34□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 VWFP04275 2813 aa3.34□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 VCANP13611 3396 aa3.34□□□□□ -1.87
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GU33 70 aa3.34□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 OXTP01178 125 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 IGIPA6NJ69 53 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 PRO0461Q9UI25 63 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 LCE6AA0A183 80 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 SZT2Q5T011 3432 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 H7BZZ5 65 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-3P60369 221 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 PRR15Q8IV56 129 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 ROMO1P60602 79 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-8P60410 259 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR4Q96PI1 79 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 KALRNO60229 2985 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 DMAC1Q96GE9 116 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 USP34Q70CQ2 3546 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 TENM4Q6N022 2769 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-1P60331 282 aa3.28□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 Q6ZR54 194 aa3.28□□□□□ -1.88
ZBED6-202ENST00000550078 TACC2O95359 2948 aa3.28□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 HIVEP1P15822 2718 aa3.27□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 Q5W150 140 aa3.27□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.27□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 LINC01546A6NGU7 62 aa3.26□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 Q8NDZ9 215 aa3.26□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-2P60368 255 aa3.26□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.25□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 30.7
ZBED6-202ENST00000550078 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.24□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.24□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-10P60014 251 aa3.24□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.24□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.23□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.23□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.23□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.23□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.22□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 SPEGQ15772 3267 aa3.22□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.22□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR1BP22528 89 aa3.22□□□□□ -1.89
ZBED6-202ENST00000550078 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.21□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.21□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 LAMA3Q16787 3333 aa3.21□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 H3BPC8 53 aa3.21□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 COL6A3P12111 3177 aa3.2□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 A8MUU9 505 aa3.19□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 PRAC1Q96KF2 57 aa3.18□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.18□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.16□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.16□□□□□ -1.9
ZBED6-202ENST00000550078 PRO0628Q9UI54 55 aa3.15□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.14□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.13□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 ZANQ9Y493 2812 aa3.13□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 EYSQ5T1H1 3165 aa3.11□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 TENM2Q9NT68 2774 aa3.11□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 TNP1P09430 55 aa3.1□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 COL4A2P08572 1712 aa3.1□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.1□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.09□□□□□ -1.91
ZBED6-202ENST00000550078 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms