RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPAG11BQ08648 103 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX17Q14061 63 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 ESRGQ1W209 222 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 ENHOQ6UWT2 76 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00575Q6W349 94 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q6ZQT0 140 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 RMI2Q96E14 147 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.53□□□□□ -2
TIMMDC1-209ENST00000498399 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 CUBNO60494 3623 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 H7BZZ5 65 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM236CP0DP71 79 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP10-1P60331 282 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 C20orf197Q8N268 126 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBL5Q9BZL1 73 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BQ85 93 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 M0R2N4 97 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDE6GP18545 87 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLKP1Q107X0 134 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q8NDZ9 215 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 MUC7Q8TAX7 377 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOTCH1P46531 2555 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 PSCAO43653 123 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 C6orf99Q4VX62 202 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZANQ9Y493 2812 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFC1O43677 76 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV6-57P01721 117 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYCNQ0VAF6 134 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 B9D2Q9BPU9 175 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUPR2A6NF83 97 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP5-8O75690 187 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERC2-IT1O76042 136 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 HAMPP81172 84 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRO0628Q9UI54 55 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNURFQ9Y675 71 aa2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 F8WEM9 126 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q6ZQY7 126 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q6ZRU5 148 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A0U1RQV1 116 aa2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 M0R378 163 aa2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 DIRC1Q969H9 104 aa2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 BPY2O14599 106 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX7BP24311 80 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 NREPQ16612 68 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCXQ7RTU7 201 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 C15orf56Q8N910 161 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 APLNQ9ULZ1 77 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GVX0 72 aa2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV4-1P06312 121 aa2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 TGP01266 2768 aa2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 LCE6AA0A183 80 aa2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GW54 56 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00483Q53H64 154 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 hDV103S1A0JD37 113 aa2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1-209ENST00000498399 LY6G6CO95867 125 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms