RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493957.5

UBA3-211, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBA3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3-211ENST00000493957 H7C2G1 150 aa6.69□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 FXYD2P54710 66 aa6.69□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.69□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 CEND1Q8N111 149 aa6.69□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.68□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 TAL2Q16559 108 aa6.67□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 Q1RN00 199 aa6.67□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 A0A0B4J2C4 111 aa6.66□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 LINC00575Q6W349 94 aa6.66□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 SMIM29Q86T20 159 aa6.66□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 RAB37Q96AX2 223 aa6.66□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.65□□□□□ -1.34
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UBA3-211ENST00000493957 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.65□□□□□ -1.34
UBA3-211ENST00000493957 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 HSD52Q0P140 79 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 VAMP3Q15836 100 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 Q8N377 158 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 PRO1933Q9H354 126 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.64□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 A0A0G2JQZ4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 K7ERJ3 54 aa6.63□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.63□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 hADV29S1A0JD25 119 aa6.62□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 Q6ZQY7 126 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBA3-211ENST00000493957 SLC25A20O43772 301 aa6.61□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 SPINK1P00995 79 aa6.61□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.61□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.61□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 CTAG1AP78358 180 aa6.6□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.6□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.59□□□□□ -1.35
UBA3-211ENST00000493957 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.58□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 TRIAP1O43715 76 aa6.58□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 SMIM6P0DI80 62 aa6.58□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 CLEC2BQ92478 149 aa6.55□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 H0YGX0 51 aa6.54□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 RNF213Q63HN8 5207 aa6.53□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 TPRXLQ17RH7 258 aa6.53□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
UBA3-211ENST00000493957 F8WEM9 126 aa6.52□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 H3BUT2 72 aa6.51□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 PSMB2P49721 201 aa6.51□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 CD164Q04900 197 aa6.51□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.51□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.5□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 IGFL1Q6UW32 110 aa6.5□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.49□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.49□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 LIMD2Q9BT23 127 aa6.49□□□□□ -1.37
UBA3-211ENST00000493957 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBA3-211ENST00000493957 CDIP1Q9H305 208 aa6.48□□□□□ -1.37
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UBA3-211ENST00000493957 Q6JHZ5 121 aa6.46□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 TSTD3H0UI37 97 aa6.45□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 FABP2P12104 132 aa6.45□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 C1orf195Q5TG92 126 aa6.45□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 Q5XG85 94 aa6.45□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.44□□□□□ -1.38
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UBA3-211ENST00000493957 A0A1B0GV72 72 aa6.43□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 MUC17Q685J3 4493 aa6.43□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 LST1O00453 97 aa6.42□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 DNAL4O96015 105 aa6.42□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.42□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 BATFQ16520 125 aa6.42□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.42□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 C9orf92A6NGG3 77 aa6.41□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 H3BMG7 143 aa6.41□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 TRACP01848 142 aa6.4□□□□□ -1.38
UBA3-211ENST00000493957 TCL1BO95988 128 aa6.39□□□□□ -1.39
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UBA3-211ENST00000493957 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.36□□□□□ -1.39
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UBA3-211ENST00000493957 TEN1Q86WV5 123 aa6.35□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.35□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.35□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 A0A087WSZ3 146 aa6.34□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 H3BQ85 93 aa6.34□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.34□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 UBE2V1Q13404 147 aa6.34□□□□□ -1.39
UBA3-211ENST00000493957 TAX1BP3O14907 124 aa6.33□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 ATXN8Q156A1 80 aa6.33□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.33□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 Q96NJ1 140 aa6.32□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.3□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 C9orf118A6NHY6 69 aa6.3□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.3□□□□□ -1.4
UBA3-211ENST00000493957 CCKP06307 115 aa6.29□□□□□ -1.4
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