RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 H3BMG7 143 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 SPRR4Q96PI1 79 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GV90 55 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 GHRHP01286 108 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 C9JAW5 83 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 H3BQ85 93 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 SPRR1BP22528 89 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 LINC00483Q53H64 154 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 Q8N377 158 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-208ENST00000438888 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 MTURNQ8N3F0 131 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 MUC2Q02817 5179 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 H3BT86 120 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 UBE2V1Q13404 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 PRO0461Q9UI25 63 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 SMIM29Q86T20 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 A0A087X002 238 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 F8WEM9 126 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRAME-208ENST00000438888 CRYGAP11844 174 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 F8W1H4 67 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 A0A0U1RQV1 116 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GV72 72 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 MOBPQ13875 183 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 Q8NBF4 154 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-208ENST00000438888 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 Q6JHZ5 121 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 TEN1Q86WV5 123 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 ETDBQ3ZM63 59 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 IGFL1Q6UW32 110 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 DSCR8Q96T75 97 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JQZ4 141 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 CDIP1Q9H305 208 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-208ENST00000438888 PDE6GP18545 87 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZQT0 140 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 CCKP06307 115 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PNM2 257 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 CD164Q04900 197 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 VPS25Q9BRG1 176 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 Q6Q795 121 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 MUC17Q685J3 4493 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 TPRXLQ17RH7 258 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-208ENST00000438888 SPINK1P00995 79 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WSZ3 146 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GW54 56 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 LIMD2Q9BT23 127 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-208ENST00000438888 Q5XG85 94 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 J3QR89 54 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 ACYP1P07311 99 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 LINC00846Q9NV44 126 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-208ENST00000438888 NREPQ16612 68 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-208ENST00000438888 UBL5Q9BZL1 73 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-208ENST00000438888 K7ERU9 68 aa6.94□□□□□ -1.3
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