RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 SPRR4Q96PI1 79 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 K7EQZ3 153 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 DNAH2Q9P225 4427 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-202ENST00000420808 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 EPM2AB3EWF7 344 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 C4orf26Q17RF5 130 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 A0A087WSZ3 146 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 Q5XG85 94 aa9.68□□□□□ -0.86
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NISCH-202ENST00000420808 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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NISCH-202ENST00000420808 A0A0U1RQV1 116 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-202ENST00000420808 UBE2AP49459 152 aa9.65□□□□□ -0.86
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NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GW54 56 aa9.63□□□□□ -0.87
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NISCH-202ENST00000420808 TGP01266 2768 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 FBN3Q75N90 2809 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.6□□□□□ -0.87
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NISCH-202ENST00000420808 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 C14orf177Q52M58 125 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-202ENST00000420808 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.58□□□□□ -0.88
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NISCH-202ENST00000420808 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NISCH-202ENST00000420808 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.54□□□□□ -0.88
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-202ENST00000420808 LCE6AA0A183 80 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-202ENST00000420808 SPRR1BP22528 89 aa9.53□□□□□ -0.88
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NISCH-202ENST00000420808 H0Y9J4 135 aa9.52□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.51□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 A0A087WTM6 91 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 PRR4Q16378 134 aa9.48□□□□□ -0.89
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NISCH-202ENST00000420808 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.48□□□□□ -0.89
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
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NISCH-202ENST00000420808 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.45□□□□□ -0.9
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NISCH-202ENST00000420808 RTL8CO15255 209 aa9.44□□□□□ -0.9
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NISCH-202ENST00000420808 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.43□□□□□ -0.9
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NISCH-202ENST00000420808 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.42□□□□□ -0.9
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NISCH-202ENST00000420808 CASC2Q6XLA1 102 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-202ENST00000420808 A8MWP4 228 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-202ENST00000420808 Q96NJ1 140 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-202ENST00000420808 MOBPQ13875 183 aa9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-202ENST00000420808 Q6ZR54 194 aa9.38□□□□□ -0.91
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NISCH-202ENST00000420808 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-202ENST00000420808 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-202ENST00000420808 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.36□□□□□ -0.91
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NISCH-202ENST00000420808 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.35□□□□□ -0.91
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NISCH-202ENST00000420808 H0Y9P7 68 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-202ENST00000420808 LINC00483Q53H64 154 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 MP68P56378 58 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 A0A087X002 238 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-202ENST00000420808 ZNF861PO60384 105 aa9.28□□□□□ -0.92
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NISCH-202ENST00000420808 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 PKD1P98161 4303 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-2P60368 255 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 NDUFB1O75438 58 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
NISCH-202ENST00000420808 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 IGLV7-43P04211 117 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 PCOTHQ58A44 107 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GVX0 72 aa9.19□□□□□ -0.94
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