RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC7Q96NW7 1537 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SCAPERQ9BY12 1400 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LCE6AA0A183 80 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSTD3H0UI37 97 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 K7ERU9 68 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GNG11P61952 73 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WT1-ASQ06250 92 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGPD1P0DJD0 1748 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAP1L6A6NFF2 107 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CENPHQ9H3R5 247 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 E5RI56 91 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM262E9PQX1 116 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLC2P0DOY2 106 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLC3P0DOY3 106 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHMP6Q96FZ7 201 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CGREF1Q99674 301 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AIF1LQ9BQI0 150 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERVK-7P63135 1459 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 M0QY20 66 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 M0R2Z0 102 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LEPROTL1O95214 131 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACYP1P07311 99 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DDA1Q9BW61 102 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMIM3Q9BZL3 60 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LOC400499M0QZD8 3231 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MLH3Q9UHC1 1453 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COPZ1P61923 177 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALKAL2Q6UX46 152 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APOC2P02655 101 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CATR1Q13166 79 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PFDN5Q99471 154 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PIK3C2BO00750 1634 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PMCHL1Q16048 86 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 USP34Q70CQ2 3546 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BUA1 57 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HMGN3Q15651 99 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FOCADQ5VW36 1801 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GAFA1Q96PS6 74 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAIPQ13075 1403 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPLO60437 1756 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ABCA3Q99758 1704 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM218A2RU14 115 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRTDAPP60985 99 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TTTY10Q9BZA0 68 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIF21BO75037 1637 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP10BO94823 1461 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MPC2O95563 127 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARHGAP5Q13017 1502 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VCANP13611 3396 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DR1Q01658 176 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UNC80Q8N2C7 3258 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLIN4Q96Q06 1357 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM24AA6NFZ4 105 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 D6R8Y8 96 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CROCC2H7BZ55 1655 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DIP2BQ9P265 1576 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFC1O43677 76 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UQCRHP07919 91 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SFTA3P0C7M3 94 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSTD1Q8NFU3 115 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD163L1Q9NR16 1453 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BQ15 152 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC88BA6NC98 1476 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NRAPQ86VF7 1730 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A1B0GUT8 65 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IQCF6A8MYZ5 107 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OOSP1A8MZH6 123 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NBEAP1P0C6P0 100 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 G0S2P27469 103 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GNG10P50151 68 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CKS1BP61024 79 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC58Q4VC31 144 aa-3.15□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms