RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 C1orf21Q9H246 121 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 J3KRW8 73 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PSMD11O00231 422 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SELENOWP63302 87 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PSPHP78330 225 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PMS2P3Q13401 168 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC51BQ86UW2 128 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARMC7Q9H6L4 198 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PARVAQ9NVD7 372 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 USE1Q9NZ43 259 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 NCAPD2Q15021 1401 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 G3V2T6 193 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 MPC2O95563 127 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 G0S2P27469 103 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CKS2P33552 79 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 S100A10P60903 97 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCL8P80075 99 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAB11BQ15907 218 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SYCP3Q8IZU3 236 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A087WXM4 84 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A0U1RRA0 63 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMIM17P0DL12 118 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 IFT20Q8IY31 132 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 DYDC1Q8WWB3 177 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCL13Q99616 98 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 HSPB11Q9Y547 144 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A0U1RQV5 110 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1B0GUT8 65 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PDE6DO43924 150 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CYB5AP00167 134 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SSTP61278 116 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CBX1P83916 185 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 BORCS8Q96FH0 119 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM216Q9P0N5 145 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 K7ERJ3 54 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 BORCS7Q96B45 105 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 SAR1AQ9NR31 198 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMKR1H3BMG3 65 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 FTH1P02794 183 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 COPZ1P61923 177 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLGLB1Q02325 96 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 VAMP3Q15836 100 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 TSTD1Q8NFU3 115 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 TIPINQ9BVW5 301 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PRQ8 180 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 M0R1W7 72 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 YKT6O15498 198 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 HIST1H2BKO60814 126 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 HIST1H2BJP06899 126 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 NAA20P61599 178 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLGLAQ15195 96 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 S100ZQ8WXG8 99 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 MYLPFQ96A32 169 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 CXorf40BQ96DE9 158 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 CGREF1Q99674 301 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 CENPKQ9BS16 269 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 PFDN4Q9NQP4 134 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PPV4 95 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 COX6CP09669 75 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 CAV1Q03135 178 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 FABP9Q0Z7S8 132 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-540P-201ENST00000384622 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
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