RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.82□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 H3BPC8 53 aa6.81□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 PRR15Q8IV56 129 aa6.81□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.81□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 C1orf195Q5TG92 126 aa6.8□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 A0A1B0GVX0 72 aa6.79□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 COL6A3P12111 3177 aa6.79□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMX3-201ENST00000299608 VCANP13611 3396 aa6.78□□□□□ -1.32
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TMX3-201ENST00000299608 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMX3-201ENST00000299608 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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TMX3-201ENST00000299608 COA5Q86WW8 74 aa6.67□□□□□ -1.34
TMX3-201ENST00000299608 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.65□□□□□ -1.34
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TMX3-201ENST00000299608 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.62□□□□□ -1.35
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TMX3-201ENST00000299608 ZANQ9Y493 2812 aa6.61□□□□□ -1.35
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TMX3-201ENST00000299608 Q6ZSA8 131 aa6.61□□□□□ -1.35
TMX3-201ENST00000299608 A8MUN3 132 aa6.6□□□□□ -1.35
TMX3-201ENST00000299608 LINC01554Q52M75 96 aa6.59□□□□□ -1.35
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-2P60368 255 aa6.58□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.58□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.58□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 KLKP1Q107X0 134 aa6.57□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-1P60331 282 aa6.57□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 CD164Q04900 197 aa6.57□□□□□ -1.36
TMX3-201ENST00000299608 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.56□□□□□ -1.36
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TMX3-201ENST00000299608 Q5VSD8 79 aa6.54□□□□□ -1.36
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TMX3-201ENST00000299608 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.53□□□□□ -1.36
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TMX3-201ENST00000299608 H7BZZ5 65 aa6.52□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 A0A0D9SG42 100 aa6.5□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 TENM3Q9P273 2699 aa6.49□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 PANO1I0J062 215 aa6.48□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 SPEGQ15772 3267 aa6.48□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.47□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.47□□□□□ -1.37
TMX3-201ENST00000299608 NF1P21359 2839 aa6.45□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 Q6ZR54 194 aa6.45□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 OCR1Q9BZK8 76 aa6.45□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.45□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 SPRR1BP22528 89 aa6.44□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.43□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 HRES1P13985 223 aa6.43□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.42□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 CRIPTQ9P021 101 aa6.4□□□□□ -1.38
TMX3-201ENST00000299608 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.39□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 FBN2P35556 2912 aa6.38□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.37□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 SPINK7P58062 85 aa6.37□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 USP34Q70CQ2 3546 aa6.37□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.36□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.36□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 CSAG1Q6PB30 78 aa6.34□□□□□ -1.39
TMX3-201ENST00000299608 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.33□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 A0A087X002 238 aa6.33□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.33□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 Q5W150 140 aa6.33□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 A0A1B0GU33 70 aa6.29□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.29□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.29□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.28□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 LINC00483Q53H64 154 aa6.28□□□□□ -1.4
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.27□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 S4R3F8 94 aa6.27□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 TENM2Q9NT68 2774 aa6.27□□□□□ -1.41
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