RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 C1orf195Q5TG92 126 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.59□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 BCE1O60756 84 aa3.58□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.57□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 Q8NDZ9 215 aa3.57□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.56□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 A0A087WTM6 91 aa3.55□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 LIMD2Q9BT23 127 aa3.53□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 DSCR10P59022 87 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 Q96NJ1 140 aa3.53□□□□□ -1.84
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LMO3-201ENST00000261169 ZNF861PO60384 105 aa3.52□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 PRR15Q8IV56 129 aa3.52□□□□□ -1.85
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LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GW54 56 aa3.5□□□□□ -1.85
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LMO3-201ENST00000261169 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 ACYP2P14621 99 aa3.49□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 FAM229AH3BQW9 127 aa3.49□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 KLKP1Q107X0 134 aa3.49□□□□□ -1.85
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LMO3-201ENST00000261169 H3BPC8 53 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.44□□□□□ -1.86
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LMO3-201ENST00000261169 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 ZFHX3Q15911 3703 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 WIPF1O43516 503 aa3.43□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 OCR1Q9BZK8 76 aa3.43□□□□□ -1.86
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LMO3-201ENST00000261169 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.41□□□□□ -1.86
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LMO3-201ENST00000261169 KRTAP10-2P60368 255 aa3.36□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 LINC01554Q52M75 96 aa3.36□□□□□ -1.87
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LMO3-201ENST00000261169 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.35□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 HRES1P13985 223 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.34□□□□□ -1.88
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