RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	COA5	Q86WW8	74 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	VPREB1	P12018	145 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	ITPR1	Q14643	2758 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895		Q5VV11	94 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPIN3-231	ENST00000639895	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	C8orf87	E5RJ46	101 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP10-9	P60411	292 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	CHD6	Q8TD26	2715 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	ZZEF1	O43149	2961 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GW54	56 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BPC8	53 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAC1	Q96KF2	57 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		A8MU10	97 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8N377	158 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0G2JQZ4	141 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PNN7	141 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8NDZ9	215 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PNM2	257 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895		J3QKU1	62 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895		Q9BRP9	147 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	PRLH	P81277	87 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GU69	56 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895		Q6ZRX8	168 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	ATM	Q13315	3056 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895		Q75L30	129 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC01554	Q52M75	96 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	LRBA	P50851	2863 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	DSCR10	P59022	87 aa		7.46	□□□□□ -1.21
SPIN3-231	ENST00000639895	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	USP24	Q9UPU5	2620 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00313	P59037	77 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	MOBP	Q13875	183 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPIN3-231	ENST00000639895	IGFL1	Q6UW32	110 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	ACYP2	P14621	99 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	SPINK7	P58062	85 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895		A8MWP4	228 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	SPINK1	P00995	79 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895		K7ERS5	55 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895		X6R8D5	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	INAFM1	C9JVW0	142 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	UQCR11	O14957	56 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPIN3-231	ENST00000639895		A6NN06	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	SMR3A	Q99954	134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	COL12A1	Q99715	3063 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8NAQ8	132 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPIN3-231	ENST00000639895	NOTCH1	P46531	2555 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC3A	Q02505	3323 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	CSAG1	Q6PB30	78 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms