RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 A0A0B4J2C4 111 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 A6NJY4 79 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 K7ERJ3 54 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV7-43P04211 117 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 H7C2G1 150 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 PRLHP81277 87 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 RAB37Q96AX2 223 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1B0GWB2 263 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 C6orf99Q4VX62 202 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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ITGB5-211ENST00000608107 B5MCH6 92 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 M0R143 59 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 UBE2AP49459 152 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 BATFQ16520 125 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 DIRC1Q969H9 104 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF861PO60384 105 aa6.23□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 Q9BRP9 147 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 HERC2O95714 4834 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB5-211ENST00000608107 ERC2-IT1O76042 136 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 Q1RN00 199 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZRX8 168 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 TSPAN13O95857 204 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 COX7BP24311 80 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 H0Y9J4 135 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 TRIAP1O43715 76 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 PSMB2P49721 201 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 VAMP3Q15836 100 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00575Q6W349 94 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 TAX1BP3O14907 124 aa6.15□□□□□ -1.42
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.15□□□□□ -1.42
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ITGB5-211ENST00000608107 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.14□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 SPRR4Q96PI1 79 aa6.13□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 hADV29S1A0JD25 119 aa6.12□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 H0YGX0 51 aa6.12□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.12□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 C9orf118A6NHY6 69 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 H3BUT2 72 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 SLC25A20O43772 301 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 A0A087X002 238 aa6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 COX6CP09669 75 aa6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZQY7 126 aa6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.1□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00483Q53H64 154 aa6.08□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 Q8N377 158 aa6.08□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.08□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01600Q96MT4 127 aa6.08□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.07□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 TCL1BO95988 128 aa6.07□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.07□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.06□□□□□ -1.44
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ITGB5-211ENST00000608107 A0A1B0GX51 115 aa6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1W2PPM0 123 aa6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 LST1O00453 97 aa6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 MT1HL1P0DM35 61 aa6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 SPRR1BP22528 89 aa6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 CRYGAP11844 174 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP10-8P60410 259 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM29Q86T20 159 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 MYCBP2O75592 4640 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.04□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 OXTP01178 125 aa6.04□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 SNCGO76070 127 aa6.03□□□□□ -1.44
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