RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591714.5

HDAC5-210, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC5, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-210ENST00000591714 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.59□□□□□ -0.87
HDAC5-210ENST00000591714 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 DDTP30046 118 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 LEPROTO15243 131 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 COX8AP10176 69 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 TPRXLQ17RH7 258 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 CDIP1Q9H305 208 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 DLEU1O43261 78 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 ERC2-IT1O76042 136 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 E9PLD3 99 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 Q8NBF4 154 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 LINC00587B1AMM8 73 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 B5MCH6 92 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 J3QQQ9 107 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 NMUP48645 174 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 C14orf144Q96I85 54 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HDAC5-210ENST00000591714 CTAG1AP78358 180 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 Q9BRP9 147 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 LINC00483Q53H64 154 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 A0A0U1RQV1 116 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 NPC2P61916 151 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 HIGD1BQ9P298 99 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC5-210ENST00000591714 IGLV6-57P01721 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 PCP2Q8IVA1 136 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 MOBPQ13875 183 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 Q6ZRX8 168 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 A0A0J9YXY3 114 aa9.44□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 ZNF815PA8K554 130 aa9.44□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 M0R143 59 aa9.43□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 SPINK1P00995 79 aa9.43□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 NDUFC2O95298 119 aa9.42□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.42□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.42□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 HSD52Q0P140 79 aa9.41□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.41□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.41□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.4□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 TAL2Q16559 108 aa9.4□□□□□ -0.9
HDAC5-210ENST00000591714 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.39□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 Q8N377 158 aa9.39□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 LITAFQ99732 161 aa9.39□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.39□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.39□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.38□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.35□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.35□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 TIMM17BO60830 172 aa9.34□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.34□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 HIST1H4GQ99525 98 aa9.34□□□□□ -0.91
HDAC5-210ENST00000591714 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.33□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.33□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 Q6ZVH6 145 aa9.33□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 A6NDN8 102 aa9.32□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 BATFQ16520 125 aa9.32□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.32□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 CEND1Q8N111 149 aa9.32□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.31□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 A6NJY4 79 aa9.31□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.31□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 COPS9Q8WXC6 57 aa9.31□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 SPANXCQ9NY87 97 aa9.31□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 SLC25A20O43772 301 aa9.3□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.29□□□□□ -0.92
HDAC5-210ENST00000591714 IFITM1P13164 125 aa9.27□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 SPRR1BP22528 89 aa9.26□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.26□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 FXYD2P54710 66 aa9.24□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 C6orf99Q4VX62 202 aa9.24□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 XP32Q5T750 250 aa9.24□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.23□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 COX7BP24311 80 aa9.22□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.22□□□□□ -0.93
HDAC5-210ENST00000591714 A0A1B0GWB2 263 aa9.21□□□□□ -0.94
HDAC5-210ENST00000591714 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.21□□□□□ -0.94
HDAC5-210ENST00000591714 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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