RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 H0Y9P7 68 aa7.34□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 A0A1W2PNN7 141 aa7.32□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.32□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 CENPFP49454 3210 aa7.32□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.32□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 WFDC2Q14508 124 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZR54 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00846Q9NV44 126 aa7.29□□□□□ -1.24
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SEH1L-208ENST00000590843 Q8N1X5 172 aa7.28□□□□□ -1.24
SEH1L-208ENST00000590843 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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SEH1L-208ENST00000590843 H3BPC8 53 aa7.26□□□□□ -1.25
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SEH1L-208ENST00000590843 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 KRTAP10-1P60331 282 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 ACYP2P14621 99 aa7.25□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 A8MWP4 228 aa7.25□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 PCOTHQ58A44 107 aa7.25□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 A0A096LNJ9 63 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-208ENST00000590843 DSCR10P59022 87 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 NOTCH1P46531 2555 aa7.2□□□□□ -1.26
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SEH1L-208ENST00000590843 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 KRTAP10-2P60368 255 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.18□□□□□ -1.26
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SEH1L-208ENST00000590843 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 IGFL1Q6UW32 110 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 BRK1Q8WUW1 75 aa7.16□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.16□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.15□□□□□ -1.26
SEH1L-208ENST00000590843 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.13□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.12□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 PCP4P48539 62 aa7.12□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 CENPEQ02224 2701 aa7.1□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 HRES1P13985 223 aa7.09□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZQT0 140 aa7.09□□□□□ -1.27
SEH1L-208ENST00000590843 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.08□□□□□ -1.28
SEH1L-208ENST00000590843 PRR15Q8IV56 129 aa7.07□□□□□ -1.28
SEH1L-208ENST00000590843 A6NED7 52 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-208ENST00000590843 SNURFQ9Y675 71 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-208ENST00000590843 SMIM29Q86T20 159 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-208ENST00000590843 Q8N377 158 aa7.05□□□□□ -1.28
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SEH1L-208ENST00000590843 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.03□□□□□ -1.28
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SEH1L-208ENST00000590843 CEP350Q5VT06 3117 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-208ENST00000590843 ERC2-IT1O76042 136 aa6.98□□□□□ -1.29
SEH1L-208ENST00000590843 COX7CP15954 63 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-208ENST00000590843 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-208ENST00000590843 K7EQZ3 153 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 ITPR2Q14571 2701 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 LITAFQ99732 161 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 A8MUN3 132 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 SPRR1BP22528 89 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 BPTFQ12830 3046 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-208ENST00000590843 LINC01554Q52M75 96 aa6.9□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 LINC01600Q96MT4 127 aa6.9□□□□□ -1.31
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SEH1L-208ENST00000590843 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.9□□□□□ -1.31
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SEH1L-208ENST00000590843 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 A0A087WVE0 104 aa6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 SVIPQ8NHG7 77 aa6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 S4R3F8 94 aa6.87□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 TENM4Q6N022 2769 aa6.86□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 HIVEP1P15822 2718 aa6.86□□□□□ -1.31
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SEH1L-208ENST00000590843 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.84□□□□□ -1.31
SEH1L-208ENST00000590843 PLAC4Q8WY50 150 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00483Q53H64 154 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 FAM104AQ969W3 186 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 TRANK1O15050 2925 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 AKAP13Q12802 2813 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-208ENST00000590843 A0A1W2PNM2 257 aa6.81□□□□□ -1.32
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