RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 A0A0J9YWU9 116 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 C6orf99Q4VX62 202 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 LELP1Q5T871 98 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 SCXQ7RTU7 201 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 H0YGX0 51 aa10.09□□□□□ -0.79
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CTIF-205ENST00000587860 M0R2N4 97 aa10.06□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.06□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 PRR34Q9NV39 138 aa10.03□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 NREPQ16612 68 aa10□□□□□ -0.81
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CTIF-205ENST00000587860 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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CTIF-205ENST00000587860 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.71□□□□□ -0.85
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CTIF-205ENST00000587860 C3orf84H3BNL1 204 aa9.71□□□□□ -0.86
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