RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 APLNQ9ULZ1 77 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 CENPFP49454 3210 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GVX0 72 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP10-3P60369 221 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 K7EIL1 84 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 A0A096LNT2 108 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF861PO60384 105 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRM-211ENST00000580170 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRM-211ENST00000580170 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRM-211ENST00000580170 Q1T7F1 81 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf92A6NGG3 77 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WTM6 91 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PNM2 257 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 CASC10Q5T4H9 136 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRM-211ENST00000580170 FAM104AQ969W3 186 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV7-43P04211 117 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRM-211ENST00000580170 SPRR4Q96PI1 79 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRM-211ENST00000580170 OCR1Q9BZK8 76 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRM-211ENST00000580170 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRM-211ENST00000580170 Q5XG85 94 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 J3QL48 77 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 MTORP42345 2549 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 H3BS24 57 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 POLQO75417 2590 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PTPRM-211ENST00000580170 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0D9SG42 100 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF575Q86XF7 245 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q75L30 129 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 PRR26Q8N8Z3 221 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01554Q52M75 96 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 LUZP6Q538Z0 58 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N1X5 172 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 FAM229BQ4G0N7 80 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 ACANP16112 2415 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRM-211ENST00000580170 PRAC1Q96KF2 57 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRM-211ENST00000580170 CYSTM1Q9H1C7 97 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRM-211ENST00000580170 F8P00451 2351 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GU33 70 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-211ENST00000580170 Q5VV11 94 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-211ENST00000580170 HRES1P13985 223 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRM-211ENST00000580170 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRM-211ENST00000580170 CSAG1Q6PB30 78 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRM-211ENST00000580170 TNP2Q05952 138 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRM-211ENST00000580170 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRM-211ENST00000580170 Q8NDZ9 215 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 CR1P17927 2039 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 OXTP01178 125 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 SPINK7P58062 85 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0A0MQY5 61 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRM-211ENST00000580170 DMAC1Q96GE9 116 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSA8 131 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRM-211ENST00000580170 SPRR1AP35321 89 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00483Q53H64 154 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRM-211ENST00000580170 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRM-211ENST00000580170 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRM-211ENST00000580170 Q5W150 140 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRM-211ENST00000580170 SPRR1BP22528 89 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRM-211ENST00000580170 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRM-211ENST00000580170 S4R3F8 94 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRM-211ENST00000580170 BPTFQ12830 3046 aa12.93□□□□□ -0.34
PTPRM-211ENST00000580170 USP24Q9UPU5 2620 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRM-211ENST00000580170 HECTD1Q9ULT8 2610 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRM-211ENST00000580170 ROMO1P60602 79 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRM-211ENST00000580170 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms