RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	LEPROT	O15243	131 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	MGP	P08493	103 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SMIM17	P0DL12	118 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	AQP4	P55087	323 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	C2orf82	Q6UX34	121 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	CST9L	Q9H4G1	147 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	OTOR	Q9NRC9	128 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		0.94	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084		M0R378	163 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SSSCA1	O60232	199 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	NCS1	P62166	190 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084		Q1T7F1	81 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	GGACT	Q9BVM4	153 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		0.93	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	NCR2	O95944	276 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	CD3D	P04234	171 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A6	P12236	298 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	AKAP14	Q86UN6	197 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	AP1S3	Q96PC3	154 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	FAM107B	Q9H098	131 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	NIT2	Q9NQR4	276 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	MED9	Q9NWA0	146 aa		0.92	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	PPBP	P02775	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	TRGC1	P0CF51	173 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	CRIP1	P50238	77 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	AP3S1	Q92572	193 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COX11-208	ENST00000576084	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		A0A1B0GV50	99 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	C9orf170	A2RU37	121 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	SDC2	P34741	201 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	RAB5B	P61020	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	KHDC3L	Q587J8	217 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		Q6ZUT4	128 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	CNBD2	Q96M20	576 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	FXYD2	P54710	66 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	CKS1B	P61024	79 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	MT1X	P80297	61 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	PMAIP1	Q13794	54 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		I3L3M4	83 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	ERC2-IT1	O76042	136 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	DEFA1	P59665	94 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	CCL20	P78556	96 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	NDUFA5	Q16718	116 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		Q96NJ1	140 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	EPDR1	Q9UM22	224 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		F8VRH5	84 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	CXCL1	P09341	107 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	AP3S2	P59780	193 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084		Q5XG85	94 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
COX11-208	ENST00000576084	PRRT1	Q99946	306 aa		0.87	□□□□□ -2.27

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