RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.72□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 H3BUT2 72 aa8.71□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 VAMP3Q15836 100 aa8.71□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.71□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 LRP2P98164 4655 aa8.71□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.7□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PPM0 123 aa8.7□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF861PO60384 105 aa8.7□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 ERG28Q9UKR5 140 aa8.7□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.69□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00158P58513 81 aa8.69□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 COX17Q14061 63 aa8.69□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 DAND5Q8N907 189 aa8.69□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0U1RRA0 63 aa8.68□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 FABP2P12104 132 aa8.68□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2V1Q13404 147 aa8.68□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.68□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00167Q96N53 147 aa8.68□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 GAGE10A6NGK3 116 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 BCE1O60756 84 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 PFN2P35080 140 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 NPC2P61916 151 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.67□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 TSPAN13O95857 204 aa8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.65□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.65□□□□□ -1.02
CMTM3-215ENST00000568477 K7EP34 96 aa8.64□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.64□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.63□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.63□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.6□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.6□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2D-28P01615 120 aa8.6□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 VPREB1P12018 145 aa8.6□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2AP49459 152 aa8.6□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 Q1RN00 199 aa8.59□□□□□ -1.03
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFC2O95298 119 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 PSMB2P49721 201 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 H7C2G1 150 aa8.57□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 COX6CP09669 75 aa8.56□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.56□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 CRYGAP11844 174 aa8.56□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 A0A087X002 238 aa8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 Q8NDZ9 215 aa8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM126AQ9H061 195 aa8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 TRIAP1O43715 76 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 PRLHP81277 87 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-215ENST00000568477 H3BMG7 143 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 M0R378 163 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 TCL1BO95988 128 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 F8W1H4 67 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 PRR4Q16378 134 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 RNF213Q63HN8 5207 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 ATXN8Q156A1 80 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 PRO0461Q9UI25 63 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 LPAP08519 4548 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM3-215ENST00000568477 H0YGX0 51 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 LST1O00453 97 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 NCR3O14931 201 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 PRYO14603 147 aa8.45□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.44□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.44□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 CLEC2BQ92478 149 aa8.44□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV6-57P01721 117 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 TRACP01848 142 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 C9JAW5 83 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A20O43772 301 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR1AP35321 89 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR4Q96PI1 79 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-215ENST00000568477 MTURNQ8N3F0 131 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GX51 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 H3BT86 120 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.38□□□□□ -1.07
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