RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	C14orf144	Q96I85	54 aa		12.57	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFC2	O95298	119 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		B5MCH6	92 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01545	Q5VT33	79 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV6-57	P01721	117 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf202	A1L168	122 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00483	Q53H64	154 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PET117	Q6UWS5	81 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PRO1933	Q9H354	126 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LITAF	Q99732	161 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP8	Q9BV40	100 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R143	59 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ERC2-IT1	O76042	136 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NPC2	P61916	151 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9BRP9	147 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZRX8	168 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf79	P0CE67	100 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM17B	O60830	172 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8NBF4	154 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRXL	Q17RH7	258 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC17	Q685J3	4493 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTDAP	P60985	99 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXC	Q9NY87	97 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF815P	A8K554	130 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINK1	P00995	79 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MOBP	Q13875	183 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA45	Q537H7	98 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CDIP1	Q9H305	208 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GV90	55 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ATOH7	Q8N100	152 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N377	158 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR1B	P22528	89 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PCP2	Q8IVA1	136 aa		12.25	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf99	Q4VX62	202 aa		12.24	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	IFITM1	P13164	125 aa		12.23	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		12.23	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZVH6	145 aa		12.23	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200	COX7B	P24311	80 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0U1RQV1	116 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS9	Q8WXC6	57 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A20	O43772	301 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DLEU1	O43261	78 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NDN8	102 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GWB2	263 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	BATF	Q16520	125 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	COX8A	P10176	69 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TAL2	Q16559	108 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM29	Q86T20	159 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200		Q1RN00	199 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200		A4D1N5	150 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMD2	Q9BT23	127 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CD164	Q04900	197 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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