RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561212.5

ZEB1-222, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 5

Gene ZEB1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		M0R378	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		H3BQ85	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZRP5	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	SLPI	P03973	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6Q795	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	COX7B	P24311	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZR54	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	CCK	P06307	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZQY7	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-222	ENST00000561212	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	PRY	O14603	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A1B0GV72	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	PDE6G	P18545	87 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	PSCA	O43653	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	SPRR1A	P35321	89 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6JHZ5	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZQT0	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZRX8	168 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		B5MCH6	92 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		M0R2N4	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A096LNI7	61 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ZEB1-222	ENST00000561212	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A087WTM6	91 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ZEB1-222	ENST00000561212	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ZEB1-222	ENST00000561212		Q9BRP9	147 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ZEB1-222	ENST00000561212	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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