RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-219ENST00000550655 Q6ZRX8 168 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-219ENST00000550655 ATOH7Q8N100 152 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-219ENST00000550655 Q9BRP9 147 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-219ENST00000550655 SPANXCQ9NY87 97 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-219ENST00000550655 ERC2-IT1O76042 136 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 LINC00483Q53H64 154 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 CTAG1AP78358 180 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 RNF213Q63HN8 5207 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 AKR1D1P51857 326 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 PCP2Q8IVA1 136 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-219ENST00000550655 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-219ENST00000550655 S100A2P29034 98 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 Q8NBF4 154 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.17□□□□□ -0.78
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CS-219ENST00000550655 S100A6P06703 90 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 MOBPQ13875 183 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 Q6ZVH6 145 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-219ENST00000550655 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 COPS9Q8WXC6 57 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 C5orf52A6NGY3 159 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
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CS-219ENST00000550655 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 COX7BP24311 80 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.1□□□□□ -0.79
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CS-219ENST00000550655 TPRXLQ17RH7 258 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-219ENST00000550655 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 SPRR1BP22528 89 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 A6NDN8 102 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GWB2 263 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 SCGB1D1O95968 90 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 Q8N377 158 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-219ENST00000550655 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.02□□□□□ -0.81
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CS-219ENST00000550655 CDIP1Q9H305 208 aa10□□□□□ -0.81
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CS-219ENST00000550655 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-219ENST00000550655 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-219ENST00000550655 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 TAL2Q16559 108 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 MUC2Q02817 5179 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 SLC25A20O43772 301 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 Q1RN00 199 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 SMIM29Q86T20 159 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 MUC17Q685J3 4493 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 DLEU1O43261 78 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 HIST1H4GQ99525 98 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 C14orf144Q96I85 54 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 C12orf57Q99622 126 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-219ENST00000550655 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.9□□□□□ -0.82
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CS-219ENST00000550655 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 LINC00575Q6W349 94 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 PRO1933Q9H354 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 CD164Q04900 197 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 VAMP3Q15836 100 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 LIMD2Q9BT23 127 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 VAMP8Q9BV40 100 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-219ENST00000550655 HIGD1BQ9P298 99 aa9.86□□□□□ -0.83
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CS-219ENST00000550655 hADV29S1A0JD25 119 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 Q6ZQY7 126 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 CFC1BP0CG36 223 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 CFC1P0CG37 223 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 H7C2G1 150 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 A0A0B4J2C4 111 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-219ENST00000550655 A0A0U1RQV1 116 aa9.79□□□□□ -0.84
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