RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0087Q14695 138 aa10.94□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.94□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 COX17Q14061 63 aa10.94□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 BCE1O60756 84 aa10.93□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.92□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 F8WDY8 70 aa10.9□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 EPM2AB3EWF7 344 aa10.89□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GUV1 79 aa10.88□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.88□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 RETNQ9HD89 108 aa10.88□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM29Q86T20 159 aa10.86□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.86□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 APOC4P55056 127 aa10.85□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.85□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV6-57P01721 117 aa10.84□□□□□ -0.67
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV4-1P06312 121 aa10.82□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 TENM3Q9P273 2699 aa10.82□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 LYRM9A8MSI8 78 aa10.82□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 PMAIP1Q13794 54 aa10.81□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.81□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.8□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.8□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 COL6A5A8TX70 2615 aa10.8□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.8□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 Q8NAQ8 132 aa10.79□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 OCR1Q9BZK8 76 aa10.79□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.77□□□□□ -0.68
CCSAP-204ENST00000483092 H3BQ85 93 aa10.77□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.77□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.77□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZTC4 211 aa10.75□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.75□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.73□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.73□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 A8MUN3 132 aa10.72□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 M0R378 163 aa10.71□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.71□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YWU9 116 aa10.71□□□□□ -0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ERC2-IT1O76042 136 aa10.7□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZRU5 148 aa10.7□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 hDV103S1A0JD37 113 aa10.69□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZRP5 223 aa10.69□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 LELP1Q5T871 98 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JQZ4 141 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PNN7 141 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-11P60412 298 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 VPREB1P12018 145 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf137Q5JT78 98 aa10.66□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.66□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.66□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.65□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 A8MU10 97 aa10.65□□□□□ -0.7
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00208Q96KT6 92 aa10.64□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 K7EQZ3 153 aa10.64□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2BP63146 152 aa10.64□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N377 158 aa10.62□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 MP68P56378 58 aa10.61□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.6□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PNM2 257 aa10.59□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PRR15Q8IV56 129 aa10.59□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PRR15LQ9BU68 103 aa10.59□□□□□ -0.71
CCSAP-204ENST00000483092 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.58□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ANK2Q01484 3957 aa10.58□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.56□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf33Q8WU49 177 aa10.56□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PRR34Q9NV39 138 aa10.55□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 SYCNQ0VAF6 134 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 A6NED7 52 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 HCG22E2RYF7 251 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 Q1T7F1 81 aa10.53□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PSCAO43653 123 aa10.52□□□□□ -0.72
CCSAP-204ENST00000483092 B9D2Q9BPU9 175 aa10.52□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 A0A096LNI7 61 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 FAM168BA1KXE4 195 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 DSCR10P59022 87 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 Q8NBF4 154 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WSZ3 146 aa10.49□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFB1O75438 58 aa10.48□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.47□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.46□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf56Q8N910 161 aa10.46□□□□□ -0.73
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.45□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2AP49459 152 aa10.45□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y9P7 68 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms