RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q96NJ1 140 aa11.43□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.42□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.41□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.41□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC01600Q96MT4 127 aa11.41□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.4□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGFL1Q6UW32 110 aa11.4□□□□□ -0.58
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM229AH3BQW9 127 aa11.39□□□□□ -0.59
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.38□□□□□ -0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.37□□□□□ -0.59
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C15orf56Q8N910 161 aa11.3□□□□□ -0.6
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PNN7 141 aa11.3□□□□□ -0.6
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-11P60412 298 aa11.26□□□□□ -0.61
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.25□□□□□ -0.61
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SZT2Q5T011 3432 aa10.99□□□□□ -0.65
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV7-43P04211 117 aa10.97□□□□□ -0.65
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0D9SG42 100 aa10.94□□□□□ -0.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WIPF1O43516 503 aa10.94□□□□□ -0.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.93□□□□□ -0.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.92□□□□□ -0.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CR1P17927 2039 aa10.87□□□□□ -0.67
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q5XG85 94 aa10.86□□□□□ -0.67
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.85□□□□□ -0.67
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.84□□□□□ -0.67
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