RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BBP33778 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BDP58876 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 NPC2P61916 151 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BCP62807 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 S100A12P80511 92 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 LINC01545Q5VT33 79 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N377 158 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 TIMM17BO60830 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 PET117Q6UWS5 81 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 SPANXCQ9NY87 97 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 SPRR1BP22528 89 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 C5orf52A6NGY3 159 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF815PA8K554 130 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 C3orf79P0CE67 100 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRF-211ENST00000467464 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A20O43772 301 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 XP32Q5T750 250 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 C6orf99Q4VX62 202 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 COX7BP24311 80 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 KRTDAPP60985 99 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRF-211ENST00000467464 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM29Q86T20 159 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 ATOH7Q8N100 152 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 PCP2Q8IVA1 136 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 IFITM1P13164 125 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 Q1RN00 199 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 LIMD2Q9BT23 127 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 C20orf202A1L168 122 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 CD164Q04900 197 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 LCE2CQ5TA81 110 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZVH6 145 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-211ENST00000467464 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1B0GWB2 263 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 TAL2Q16559 108 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 Q5XG85 94 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 A6NDN8 102 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 PRO1933Q9H354 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0G2JQZ4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 COPS9Q8WXC6 57 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 C9orf92A6NGG3 77 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf195Q5TG92 126 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 H7C2G1 150 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 PCOTHQ58A44 107 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 A4D1N5 150 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 AKR1D1P51857 326 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00575Q6W349 94 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 MT1HP80294 61 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRF-211ENST00000467464 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-211ENST00000467464 S100A6P06703 90 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZQY7 126 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-211ENST00000467464 S100A2P29034 98 aa6.38□□□□□ -1.39
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