RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q8NBF4 154 aa10.42□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.42□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00483Q53H64 154 aa10.41□□□□□ -0.74
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFC2O95298 119 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q9BRP9 147 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa10.38□□□□□ -0.75
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 NPC2P61916 151 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 E9PLD3 99 aa10.35□□□□□ -0.75
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H2BOP23527 126 aa10.31□□□□□ -0.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H2BBP33778 126 aa10.31□□□□□ -0.76
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H2BHQ93079 126 aa10.31□□□□□ -0.76
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H2BMQ99879 126 aa10.31□□□□□ -0.76
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC01545Q5VT33 79 aa10.28□□□□□ -0.76
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.26□□□□□ -0.77
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 TIMM17BO60830 172 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PET117Q6UWS5 81 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q8N377 158 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.24□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.24□□□□□ -0.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF815PA8K554 130 aa10.23□□□□□ -0.77
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 C3orf79P0CE67 100 aa10.2□□□□□ -0.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa10.2□□□□□ -0.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.19□□□□□ -0.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.18□□□□□ -0.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTDAPP60985 99 aa10.16□□□□□ -0.78
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa10.14□□□□□ -0.79
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COX7BP24311 80 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C6orf99Q4VX62 202 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C20orf202A1L168 122 aa10.11□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.1□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.09□□□□□ -0.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATOH7Q8N100 152 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LIMD2Q9BT23 127 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COPS9Q8WXC6 57 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IFITM1P13164 125 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TAL2Q16559 108 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q1RN00 199 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1B0GWB2 263 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE4AQ5TA78 99 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6ZVH6 145 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PCP2Q8IVA1 136 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A6NDN8 102 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 S100A1P23297 94 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AKR1D1P51857 326 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRO1933Q9H354 126 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CD164Q04900 197 aa10□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMIM29Q86T20 159 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A4D1N5 150 aa9.96□□□□□ -0.82
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