RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HPS1-206ENST00000462743 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-206ENST00000462743 B5MCH6 92 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-206ENST00000462743 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-206ENST00000462743 A0A087X002 238 aa7.14□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.14□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 SCGB1D1O95968 90 aa7.13□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.13□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 Q6ZRX8 168 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 SPRR4Q96PI1 79 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.1□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 DLEU1O43261 78 aa7.1□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 CTAG1AP78358 180 aa7.1□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.1□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 COX8AP10176 69 aa7.09□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.09□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 Q9BRP9 147 aa7.09□□□□□ -1.27
HPS1-206ENST00000462743 LINC00483Q53H64 154 aa7.08□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 ERC2-IT1O76042 136 aa7.07□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.06□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 A6NDN8 102 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 C6orf99Q4VX62 202 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 HIGD1BQ9P298 99 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-206ENST00000462743 A4D1N5 150 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SPRR1BP22528 89 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 COX7BP24311 80 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SPATA45Q537H7 98 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 VAMP8Q9BV40 100 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 A0A1B0GWB2 263 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 C14orf144Q96I85 54 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 A6NJY4 79 aa7□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 PYY3Q5JQD4 70 aa7□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 HIST1H4GQ99525 98 aa7□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 TSPAN13O95857 204 aa6.99□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.99□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.98□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.98□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 TAL2Q16559 108 aa6.97□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.97□□□□□ -1.29
HPS1-206ENST00000462743 Q8NBF4 154 aa6.96□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 SPINK1P00995 79 aa6.95□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 VAMP3Q15836 100 aa6.95□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 LRP2P98164 4655 aa6.94□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 CFC1BP0CG36 223 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 CFC1P0CG37 223 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 MOBPQ13875 183 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 PRR4Q16378 134 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 LINC00575Q6W349 94 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 A0A0B4J2C4 111 aa6.91□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 SMIM29Q86T20 159 aa6.91□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 CEND1Q8N111 149 aa6.91□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 SLC25A20O43772 301 aa6.9□□□□□ -1.3
HPS1-206ENST00000462743 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.89□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 Q8N377 158 aa6.89□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 C12orf57Q99622 126 aa6.89□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 RAB37Q96AX2 223 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 hADV29S1A0JD25 119 aa6.87□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.87□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.87□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 H0YGX0 51 aa6.86□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 FXYD2P54710 66 aa6.86□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 CD164Q04900 197 aa6.86□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 HSD52Q0P140 79 aa6.86□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.86□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 LPAP08519 4548 aa6.85□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.85□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 PRO1933Q9H354 126 aa6.85□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 TPRXLQ17RH7 258 aa6.84□□□□□ -1.31
HPS1-206ENST00000462743 Q1RN00 199 aa6.84□□□□□ -1.31
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