RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFTA2Q6UW10 78 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX6CP09669 75 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLC2P0DOY2 106 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLC3P0DOY3 106 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVK-7P63135 1459 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 YKT6O15498 198 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf73Q69YU5 71 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIKE1Q9BRV8 207 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 VCANP13611 3396 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM23A6NLE4 172 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAMP8Q9BV40 100 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPANXDQ9BXN6 97 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 MON2Q7Z3U7 1717 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 NESP48681 1621 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFDN1O60925 122 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF15O95150 251 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNG3P63215 75 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAP1Q96NZ9 151 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf57Q99622 126 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00474Q9P2X8 69 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ROCK1Q13464 1354 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 C5P01031 1676 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP34Q70CQ2 3546 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PRE2 83 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERICH2A1L162 156 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEPROTL1O95214 131 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCTAP57738 103 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL7P80098 99 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM20Q8N5G0 67 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC80Q8N2C7 3258 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLIN4Q96Q06 1357 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF21BO75037 1637 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCHHQ07283 1943 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q56UQ5 140 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 CROCC2H7BZ55 1655 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 MANBALQ9NQG1 85 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF1AQ12756 1690 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP10BO94823 1461 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 F6UZH7 168 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCTP09683 121 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED14O60244 1454 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q0VG73 95 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCEAL4Q96EI5 215 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRO1854Q9UHT4 67 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 NWD1Q149M9 1564 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 DBIP07108 87 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNRGQ8N5I3 272 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTTY10Q9BZA0 68 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC7Q96NW7 1537 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS21Q2M5E4 152 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAFA1Q96PS6 74 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOA2Q15596 1464 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFC1O43677 76 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIGD1AQ9Y241 93 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEA1Q15075 1411 aa-4.22□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPEF2Q9C093 1822 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 BOLA2Q9H3K6 86 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD163L1Q9NR16 1453 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOP2BQ02880 1626 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLC6P0CF74 106 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPM4P67936 248 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBR1Q8IWV7 1749 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM262E9PQX1 116 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNG11P61952 73 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC58Q4VC31 144 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP19Q96LK0 163 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 RERGLQ9H628 205 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAPERQ9BY12 1400 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf54Q8WWF1 131 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM218A2RU14 115 aa-4.28□□□□□ -3.09
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