RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CD164Q04900 197 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 COX19Q49B96 90 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 S100PP25815 95 aa10□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SEC11CQ9BY50 192 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFC2O95298 119 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 Q5XG85 94 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PRO1933Q9H354 126 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXD12-201ENST00000404162 LCE2BO14633 110 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 Q1RN00 199 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM29Q86T20 159 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JQZ4 141 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 NPC2P61916 151 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 MT2AP02795 61 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXD12-201ENST00000404162 LEPROTO15243 131 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 TAL2Q16559 108 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD7Q86VX2 200 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 AKR1D1P51857 326 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM218A2RU14 115 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 IFITM2Q01629 132 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf202A1L168 122 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 J3QQQ9 107 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXD12-201ENST00000404162 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 MT1FP04733 61 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 RHEBQ15382 184 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 H0Y8G0 127 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 COX7BP24311 80 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 Q75L30 129 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 NMUP48645 174 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 TCL1BO95988 128 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 UQCC3Q6UW78 93 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 PCP2Q8IVA1 136 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXD12-201ENST00000404162 CLLU1Q5K131 121 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0J9YXY3 114 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf99Q4VX62 202 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXCQ9NY87 97 aa9.74□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 HERVK_113P61574 105 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP10-10P60014 251 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 PLNP26678 52 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 HSBP1O75506 76 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00846Q9NV44 126 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 LITAFQ99732 161 aa9.68□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 DPM2O94777 84 aa9.67□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.67□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 IGKCP01834 107 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXD12-201ENST00000404162 LEPROTL1O95214 131 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 Q96NJ1 140 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GWB2 263 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 E9PLD3 99 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 TIMM17BO60830 172 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 FAM236CP0DP71 79 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 FABP4P15090 132 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 IGFL1Q6UW32 110 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 A8MUU9 505 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00310P59036 64 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 F8WEM9 126 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 NEBP20929 6669 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 SERF1AO75920 110 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 YPEL4Q96NS1 127 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC2BQ92478 149 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 A4D1N5 150 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 A6NDN8 102 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 Q6JHZ5 121 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LST1O00453 97 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms