RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL6A3P12111 3177 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MUC2Q02817 5179 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A087WXM4 84 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPRR2AP35326 72 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LINC00158P58513 81 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AKAP12Q02952 1782 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NCOA2Q15596 1464 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ALKQ9UM73 1620 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IFI6P09912 130 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD5Q99666 1765 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 H3BUT2 72 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NDUFA4O00483 81 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NREPQ16612 68 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PKHD1P08F94 4074 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIF14Q15058 1648 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PDZD2O15018 2839 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMARCA2P51531 1590 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AKAP13Q12802 2813 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LCE6AA0A183 80 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFA5Q01523 94 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRANK1O15050 2925 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CREBBPQ92793 2442 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 H3BNG1 76 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPRR2EP22531 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MED14O60244 1454 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 REV3LO60673 3130 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NWD1Q149M9 1564 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCC1P33527 1531 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 H0YAA0 97 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ERVK-7P63135 1459 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IAPPP10997 89 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRLHP81277 87 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TGP01266 2768 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms