RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 COL7A1Q02388 2944 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PNN7 141 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM223A0PJW6 202 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YXY3 114 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 A4D1N5 150 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 Q9BRP9 147 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 M0R2T5 61 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 LST1O00453 97 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 FAM104AQ969W3 186 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 H0YGX0 51 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZVH6 145 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRC-201ENST00000348564 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 DNHD1Q96M86 4753 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PRYO14603 147 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZQY7 126 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GWB2 263 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 HSD52Q0P140 79 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C9JAW5 83 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf47Q569G3 176 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 H3BUT2 72 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 NREPQ16612 68 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf92A6NGG3 77 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 CFC1BP0CG36 223 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 CFC1P0CG37 223 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 OXTP01178 125 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 HIGD1BQ9P298 99 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 TAX1BP3O14907 124 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 CEND1Q8N111 149 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 B5MCH6 92 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 Q8NBF4 154 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRC-201ENST00000348564 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 CCKP06307 115 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 K7EP34 96 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 K7ERJ3 54 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WSZ3 146 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 Q6JHZ5 121 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV4-1P06312 121 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 UBL5Q9BZL1 73 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf118A6NHY6 69 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM17BO60830 172 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0087Q14695 138 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC2BQ92478 149 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-201ENST00000348564 VPREB1P12018 145 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 H3BQ85 93 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZSA8 131 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFC2O95298 119 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 Q96NJ1 140 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 LITAFQ99732 161 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK1P00995 79 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZRX8 168 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 F8W1H4 67 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPM0 123 aa2.75□□□□□ -1.97
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