RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.84□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZQY7 126 aa10.84□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.83□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 KLKP1Q107X0 134 aa10.83□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 UBL5Q9BZL1 73 aa10.82□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.82□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 VPREB1P12018 145 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 M0R2N4 97 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 DIRC1Q969H9 104 aa10.81□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 HAMPP81172 84 aa10.79□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZQT0 140 aa10.78□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZRP5 223 aa10.78□□□□□ -0.68
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.77□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 COX7BP24311 80 aa10.76□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 PMAIP1Q13794 54 aa10.76□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.75□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.74□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 M0R378 163 aa10.74□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 COL6A5A8TX70 2615 aa10.74□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.73□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.73□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SYCNQ0VAF6 134 aa10.72□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SCXQ7RTU7 201 aa10.71□□□□□ -0.69
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 CASC10Q5T4H9 136 aa10.7□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.69□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.69□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.69□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.69□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.69□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.67□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFC1O43677 76 aa10.66□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZVQ6 151 aa10.66□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.65□□□□□ -0.7
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.64□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 C7orf33Q8WU49 177 aa10.64□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 FAM168BA1KXE4 195 aa10.63□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 H3BQ85 93 aa10.63□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.63□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 BCE1O60756 84 aa10.63□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.62□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 NREPQ16612 68 aa10.62□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 PDE6GP18545 87 aa10.61□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.61□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.6□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.6□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 PRR15Q8IV56 129 aa10.59□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 K7EIL1 84 aa10.59□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
SHQ1-201ENST00000325599 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.57□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 PSPHP1O15172 72 aa10.57□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.57□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 LYSTQ99698 3801 aa10.57□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.56□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 Q8N9L7 120 aa10.55□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 BPY2O14599 106 aa10.55□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 Q8N377 158 aa10.55□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 PRYO14603 147 aa10.54□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 Q9BRP9 147 aa10.53□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 COL7A1Q02388 2944 aa10.53□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.53□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 CD164Q04900 197 aa10.52□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.52□□□□□ -0.72
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.52□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 CXCL6P80162 114 aa10.52□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.51□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.51□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZRX8 168 aa10.51□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 A8MU10 97 aa10.5□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.5□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 C3orf84H3BNL1 204 aa10.49□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.48□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.48□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.48□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 SPRR1AP35321 89 aa10.47□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 ERC2-IT1O76042 136 aa10.47□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.46□□□□□ -0.73
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.46□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.44□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 TENM2Q9NT68 2774 aa10.43□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 hDV103S1A0JD37 113 aa10.43□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 PRR4Q16378 134 aa10.42□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2BP63146 152 aa10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.4□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PNM2 257 aa10.4□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 OCR1Q9BZK8 76 aa10.4□□□□□ -0.74
SHQ1-201ENST00000325599 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms