RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa18.31■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 TLX1NBP0CAT3 122 aa18.29■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 C20orf197Q8N268 126 aa18.29■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 MAST4O15021 2626 aa18.28■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa18.27■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 C7orf33Q8WU49 177 aa18.26■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 TRAV10A0A0B4J240 114 aa18.25■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa18.25■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 ANK2Q01484 3957 aa18.24■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 SCXQ7RTU7 201 aa18.21■□□□□ 0.51
UBP1-201ENST00000283628 MRAPQ8TCY5 172 aa18.19■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa18.19■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa18.18■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 KLKP1Q107X0 134 aa18.18■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 COL6A5A8TX70 2615 aa18.17■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 TENM3Q9P273 2699 aa18.16■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 PRYO14603 147 aa18.16■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 Q8N377 158 aa18.16■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa18.16■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRX8 168 aa18.15■□□□□ 0.5
UBP1-201ENST00000283628 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 NREPQ16612 68 aa18.14■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 LINC00588Q9Y4M8 146 aa18.13■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 K7EIL1 84 aa18.13■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 H7BZZ5 65 aa18.12■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 DEFB105AQ8NG35 78 aa18.12■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa18.11■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 RMI2Q96E14 147 aa18.11■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GW54 56 aa18.11■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 SPRR1AP35321 89 aa18.11■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 TM2D3Q9BRN9 247 aa18.11■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa18.1■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM236CP0DP71 79 aa18.1■□□□□ 0.49
UBP1-201ENST00000283628 OXTP01178 125 aa18.08■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa18.07■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 RPL37AP8A6NKH3 93 aa18.07■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 IGKV4-1P06312 121 aa18.07■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 Q9BRP9 147 aa18.07■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 FAM168BA1KXE4 195 aa18.05■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 BPY2O14599 106 aa18.05■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 CASC10Q5T4H9 136 aa18.04■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 C3orf84H3BNL1 204 aa18.03■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 NOTCH1P46531 2555 aa18.02■□□□□ 0.48
UBP1-201ENST00000283628 NDUFC1O43677 76 aa18.02■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 ERC2-IT1O76042 136 aa18.01■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 SNURFQ9Y675 71 aa18.01■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 TNP2Q05952 138 aa18■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa18■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 Q8N9L7 120 aa18■□□□□ 0.47
UBP1-201ENST00000283628 C1orf137Q5JT78 98 aa17.95■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 SERP1Q9Y6X1 66 aa17.95■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 MDFIQ99750 246 aa17.95■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PNM2 257 aa17.94■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 F8WEM9 126 aa17.94■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa17.93■□□□□ 0.46
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UBP1-201ENST00000283628 Q8NBF4 154 aa17.92■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 TMEM254Q8TBM7 123 aa17.91■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 OCR1Q9BZK8 76 aa17.91■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 DNAH1Q9P2D7 4330 aa17.9■□□□□ 0.46
UBP1-201ENST00000283628 SPRR4Q96PI1 79 aa17.89■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 REG3GQ6UW15 175 aa17.88■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 UBE2BP63146 152 aa17.87■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 C5orf47Q569G3 176 aa17.87■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 Q5XG85 94 aa17.85■□□□□ 0.45
UBP1-201ENST00000283628 MGAM2Q2M2H8 2515 aa17.79■□□□□ 0.44
UBP1-201ENST00000283628 A0A0U1RQV1 116 aa17.78■□□□□ 0.44
UBP1-201ENST00000283628 SMIM29Q86T20 159 aa17.77■□□□□ 0.44
UBP1-201ENST00000283628 C16orf90A8MZG2 172 aa17.75■□□□□ 0.43
UBP1-201ENST00000283628 CNBPP62633 177 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
UBP1-201ENST00000283628 C4orf26Q17RF5 130 aa17.75■□□□□ 0.43
UBP1-201ENST00000283628 LINC00476Q8WZB0 136 aa17.72■□□□□ 0.43
UBP1-201ENST00000283628 A0A096LNI7 61 aa17.71■□□□□ 0.43
UBP1-201ENST00000283628 DSCR10P59022 87 aa17.7■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 B9D2Q9BPU9 175 aa17.68■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 DNAH9Q9NYC9 4486 aa17.67■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa17.67■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 SMIM26A0A096LP01 95 aa17.66■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 LCE6AA0A183 80 aa17.65■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa17.65■□□□□ 0.42
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa17.64■□□□□ 0.41
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UBP1-201ENST00000283628 PSCAO43653 123 aa17.63■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 IGFL1Q6UW32 110 aa17.63■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 HRCT1Q6UXD1 115 aa17.63■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 FAM30AQ9NZY2 134 aa17.63■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 K7EQZ3 153 aa17.62■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 HIGD2AQ9BW72 106 aa17.62■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 PRLHP81277 87 aa17.62■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 C14orf177Q52M58 125 aa17.6■□□□□ 0.41
UBP1-201ENST00000283628 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa17.56■□□□□ 0.4
UBP1-201ENST00000283628 HCG22E2RYF7 251 aa17.54■□□□□ 0.4
UBP1-201ENST00000283628 COL7A1Q02388 2944 aa17.54■□□□□ 0.4
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