RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 PRLHP81277 87 aa8.34□□□□□ -1.07
UBXN4-201ENST00000272638 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 C15orf56Q8N910 161 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 PDE6GP18545 87 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 VPREB1P12018 145 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.31□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 C2orf48Q96LS8 159 aa8.31□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV6-57P01721 117 aa8.31□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 C22orf24Q9Y442 160 aa8.31□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00167Q96N53 147 aa8.3□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0G2JQZ4 141 aa8.3□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PNN7 141 aa8.3□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZQT0 140 aa8.29□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 CHTF8P0CG12 524 aa8.28□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 K7EIL1 84 aa8.28□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf137Q5JT78 98 aa8.28□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.28□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
UBXN4-201ENST00000272638 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.26□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 PRR4Q16378 134 aa8.26□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.26□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 H3BQ85 93 aa8.25□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 J3KT08 172 aa8.25□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.25□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.25□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 H3BNG1 76 aa8.24□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 REG3GQ6UW15 175 aa8.23□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 TENM2Q9NT68 2774 aa8.23□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0U1RQV1 116 aa8.22□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 H0Y9J4 135 aa8.22□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.22□□□□□ -1.09
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.21□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.21□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 A0A087WSZ3 146 aa8.2□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.2□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFS5O43920 106 aa8.19□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.19□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 FAM236CP0DP71 79 aa8.19□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 LINC01600Q96MT4 127 aa8.19□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.18□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.18□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 CDK2AP2O75956 126 aa8.17□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.17□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 ERC2-IT1O76042 136 aa8.17□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZRX8 168 aa8.17□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 C14orf177Q52M58 125 aa8.16□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 B9D2Q9BPU9 175 aa8.16□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 LY6G6CO95867 125 aa8.16□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.15□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 MDFIQ99750 246 aa8.15□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 Q8N377 158 aa8.15□□□□□ -1.1
UBXN4-201ENST00000272638 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.15□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 PRYO14603 147 aa8.15□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 Q9BRP9 147 aa8.15□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM258P61165 79 aa8.14□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.14□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.13□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.12□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 CRYGAP11844 174 aa8.12□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 SVIPQ8NHG7 77 aa8.12□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.12□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.11□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 SMIM29Q86T20 159 aa8.11□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 BRK1Q8WUW1 75 aa8.11□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 WIPF1O43516 503 aa8.11□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.1□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 C4orf26Q17RF5 130 aa8.1□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.09□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 CXCL6P80162 114 aa8.09□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.09□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.09□□□□□ -1.11
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.08□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 MP68P56378 58 aa8.07□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 AKAP9Q99996 3911 aa8.07□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 EPM2AB3EWF7 344 aa8.07□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFB1O75438 58 aa8.07□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.06□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 Q8NBF4 154 aa8.06□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 F8WDY8 70 aa8.06□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 C16orf90A8MZG2 172 aa8.05□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PNM2 257 aa8.04□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 NUPR2A6NF83 97 aa8.04□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.04□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 K7EQZ3 153 aa8.03□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00208Q96KT6 92 aa8.03□□□□□ -1.12
UBXN4-201ENST00000272638 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.02□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 C5orf47Q569G3 176 aa8.02□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.99□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV4-1P06312 121 aa7.99□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 IGFL1Q6UW32 110 aa7.99□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.98□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.97□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 HCG22E2RYF7 251 aa7.97□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms