RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mrpl18Q9CQL5 180 aa11.17□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp931A2AHM2 298 aa11.17□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Crip1P63254 77 aa11.17□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tppp2Q0P5Y3 170 aa11.17□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Smim9Q3V0X1 137 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem91Q8C581 172 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1441Q8VFV3 318 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cml1Q9JIZ0 222 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 P01728 117 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Onecut2Q6XBJ3 505 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam110dQ80X91 271 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Bpifb3Q80ZU7 473 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mlst8Q9DCJ1 326 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ldlrad2Q3V0V0 142 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rnf24Q8BGI1 148 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1475Q8VEV6 314 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tspan4Q9DCK3 238 aa11.16□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fbxl7Q5BJ29 491 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prr9Q8BV84 116 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr509Q8VF20 321 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1440Q8VFV4 315 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Npc2Q9Z0J0 149 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm21900J3QP38 180 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 MsmbO08540 113 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tnfsf11O35235 316 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hoxd3P09027 433 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ifna11Q61716 190 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Oxld1Q9CR10 201 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nf1Q04690 2841 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf431E9QAG8 526 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trp53rkaQ5U452 244 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10190Q8BSD7 107 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tp53rkQ99PW4 244 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ube2l6Q9QZU9 153 aa11.15□□□□□ -0.62
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm5741B2RVA4 72 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Klk15Q8CGR4 254 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r202Q8R259 302 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem239Q9DA47 151 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpr132Q9Z282 382 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm6871L7N248 545 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp36l1P23950 338 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam210aQ8BGY7 273 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr435Q8VFS3 313 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmprss5Q9ER04 455 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rsg1A2A825 258 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sap30O88574 220 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 CebpgP53568 150 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ang6Q5GAN0 147 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mettl23A2AA28 253 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm21983D6RFS9 131 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 P01748 117 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 S100a10P08207 97 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc17a2Q5SZA1 478 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Q9D7E4 109 aa11.14□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ighv9-4A0A0A6YWH6 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1320A2AHM8 319 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tomm40Q9QYA2 361 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm28372A0A087WNV0 220 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 S100a1P56565 94 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Foxc2Q61850 494 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ube2e2Q91W82 201 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pttg1Q9CQJ7 199 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lyg1Q9D7Q0 197 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Notch3Q61982 2318 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scgb1b29D2XZ31 93 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm6970F7DCP6 221 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rnase1P00683 149 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Twist1P26687 206 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 PolqQ8CGS6 2544 aa11.13□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm7849D3YX03 116 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 OpalinQ7M750 143 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm9767G3X930 207 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr148Q60887 310 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Q8C708 225 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10118Q8C8J5 116 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1195Q8VG21 308 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Q9CRC3 126 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr218E9PWV2 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 RhebQ921J2 184 aa11.12□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 TymsP07607 307 aa11.11□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10334Q792Y8 246 aa11.11□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 Carhsp1Q9CR86 148 aa11.11□□□□□ -0.63
Gli1-201ENSMUST00000026474 1700056E22RikF7CNM6 234 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.9 ms