Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
OpalinQ7M750 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OpalinQ7M750 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OpalinQ7M750 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OpalinQ7M750 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OpalinQ7M750 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OpalinQ7M750 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OpalinQ7M750 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OpalinQ7M750 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OpalinQ7M750 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
OpalinQ7M750 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OpalinQ7M750 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OpalinQ7M750 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OpalinQ7M750 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OpalinQ7M750 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OpalinQ7M750 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OpalinQ7M750 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OpalinQ7M750 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OpalinQ7M750 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OpalinQ7M750 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OpalinQ7M750 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OpalinQ7M750 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OpalinQ7M750 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OpalinQ7M750 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OpalinQ7M750 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OpalinQ7M750 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OpalinQ7M750 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OpalinQ7M750 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OpalinQ7M750 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OpalinQ7M750 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OpalinQ7M750 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OpalinQ7M750 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OpalinQ7M750 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OpalinQ7M750 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OpalinQ7M750 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OpalinQ7M750 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OpalinQ7M750 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OpalinQ7M750 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OpalinQ7M750 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OpalinQ7M750 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OpalinQ7M750 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OpalinQ7M750 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OpalinQ7M750 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OpalinQ7M750 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OpalinQ7M750 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OpalinQ7M750 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OpalinQ7M750 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OpalinQ7M750 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OpalinQ7M750 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OpalinQ7M750 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OpalinQ7M750 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OpalinQ7M750 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OpalinQ7M750 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OpalinQ7M750 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OpalinQ7M750 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OpalinQ7M750 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OpalinQ7M750 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OpalinQ7M750 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OpalinQ7M750 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OpalinQ7M750 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OpalinQ7M750 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OpalinQ7M750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OpalinQ7M750 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OpalinQ7M750 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OpalinQ7M750 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OpalinQ7M750 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OpalinQ7M750 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OpalinQ7M750 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OpalinQ7M750 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OpalinQ7M750 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OpalinQ7M750 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OpalinQ7M750 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OpalinQ7M750 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OpalinQ7M750 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OpalinQ7M750 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OpalinQ7M750 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OpalinQ7M750 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OpalinQ7M750 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OpalinQ7M750 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OpalinQ7M750 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OpalinQ7M750 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OpalinQ7M750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OpalinQ7M750 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OpalinQ7M750 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OpalinQ7M750 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OpalinQ7M750 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OpalinQ7M750 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OpalinQ7M750 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OpalinQ7M750 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms