Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mrpl18Q9CQL5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrpl18Q9CQL5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl18Q9CQL5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mrpl18Q9CQL5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrpl18Q9CQL5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrpl18Q9CQL5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl18Q9CQL5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl18Q9CQL5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl18Q9CQL5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl18Q9CQL5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl18Q9CQL5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrpl18Q9CQL5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl18Q9CQL5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl18Q9CQL5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl18Q9CQL5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl18Q9CQL5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl18Q9CQL5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl18Q9CQL5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl18Q9CQL5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl18Q9CQL5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl18Q9CQL5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl18Q9CQL5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl18Q9CQL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl18Q9CQL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl18Q9CQL5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl18Q9CQL5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl18Q9CQL5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl18Q9CQL5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl18Q9CQL5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl18Q9CQL5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl18Q9CQL5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl18Q9CQL5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl18Q9CQL5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl18Q9CQL5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl18Q9CQL5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl18Q9CQL5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl18Q9CQL5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl18Q9CQL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl18Q9CQL5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl18Q9CQL5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl18Q9CQL5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl18Q9CQL5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl18Q9CQL5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl18Q9CQL5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl18Q9CQL5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl18Q9CQL5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl18Q9CQL5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl18Q9CQL5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl18Q9CQL5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl18Q9CQL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl18Q9CQL5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl18Q9CQL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl18Q9CQL5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl18Q9CQL5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl18Q9CQL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl18Q9CQL5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl18Q9CQL5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl18Q9CQL5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl18Q9CQL5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl18Q9CQL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl18Q9CQL5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl18Q9CQL5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl18Q9CQL5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl18Q9CQL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl18Q9CQL5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl18Q9CQL5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl18Q9CQL5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl18Q9CQL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl18Q9CQL5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl18Q9CQL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl18Q9CQL5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl18Q9CQL5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl18Q9CQL5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl18Q9CQL5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl18Q9CQL5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl18Q9CQL5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl18Q9CQL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl18Q9CQL5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl18Q9CQL5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl18Q9CQL5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl18Q9CQL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl18Q9CQL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl18Q9CQL5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl18Q9CQL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl18Q9CQL5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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