Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Q0

Lyg1, Lysozyme g-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyg1Q9D7Q0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lyg1Q9D7Q0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lyg1Q9D7Q0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lyg1Q9D7Q0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lyg1Q9D7Q0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lyg1Q9D7Q0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lyg1Q9D7Q0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lyg1Q9D7Q0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lyg1Q9D7Q0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lyg1Q9D7Q0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lyg1Q9D7Q0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lyg1Q9D7Q0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lyg1Q9D7Q0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lyg1Q9D7Q0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg1Q9D7Q0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg1Q9D7Q0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg1Q9D7Q0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg1Q9D7Q0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lyg1Q9D7Q0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lyg1Q9D7Q0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lyg1Q9D7Q0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lyg1Q9D7Q0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lyg1Q9D7Q0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lyg1Q9D7Q0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lyg1Q9D7Q0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lyg1Q9D7Q0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lyg1Q9D7Q0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lyg1Q9D7Q0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyg1Q9D7Q0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lyg1Q9D7Q0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lyg1Q9D7Q0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lyg1Q9D7Q0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lyg1Q9D7Q0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lyg1Q9D7Q0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lyg1Q9D7Q0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lyg1Q9D7Q0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lyg1Q9D7Q0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyg1Q9D7Q0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lyg1Q9D7Q0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lyg1Q9D7Q0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lyg1Q9D7Q0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lyg1Q9D7Q0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lyg1Q9D7Q0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lyg1Q9D7Q0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lyg1Q9D7Q0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lyg1Q9D7Q0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyg1Q9D7Q0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyg1Q9D7Q0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lyg1Q9D7Q0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lyg1Q9D7Q0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lyg1Q9D7Q0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lyg1Q9D7Q0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lyg1Q9D7Q0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lyg1Q9D7Q0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyg1Q9D7Q0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lyg1Q9D7Q0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lyg1Q9D7Q0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lyg1Q9D7Q0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lyg1Q9D7Q0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lyg1Q9D7Q0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lyg1Q9D7Q0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lyg1Q9D7Q0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lyg1Q9D7Q0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lyg1Q9D7Q0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lyg1Q9D7Q0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lyg1Q9D7Q0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lyg1Q9D7Q0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lyg1Q9D7Q0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lyg1Q9D7Q0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lyg1Q9D7Q0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lyg1Q9D7Q0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lyg1Q9D7Q0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lyg1Q9D7Q0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lyg1Q9D7Q0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lyg1Q9D7Q0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lyg1Q9D7Q0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lyg1Q9D7Q0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lyg1Q9D7Q0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lyg1Q9D7Q0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lyg1Q9D7Q0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lyg1Q9D7Q0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lyg1Q9D7Q0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lyg1Q9D7Q0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lyg1Q9D7Q0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lyg1Q9D7Q0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lyg1Q9D7Q0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lyg1Q9D7Q0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lyg1Q9D7Q0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lyg1Q9D7Q0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lyg1Q9D7Q0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lyg1Q9D7Q0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lyg1Q9D7Q0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lyg1Q9D7Q0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lyg1Q9D7Q0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lyg1Q9D7Q0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lyg1Q9D7Q0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lyg1Q9D7Q0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lyg1Q9D7Q0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lyg1Q9D7Q0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lyg1Q9D7Q0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms