RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 COX17Q14061 63 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK1P00995 79 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA6P56556 154 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVG6 124 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLC3P0DOY3 106 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FA2HQ7L5A8 372 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01546A6NGU7 62 aa15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00158P58513 81 aa15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM19A2Q8N3H0 131 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCR5Q8TEV8 140 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RRA0 63 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PRYO14603 147 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTA2Q6UW10 78 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 MOBPQ13875 183 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE2AQ6NT46 116 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 NCR3O14931 201 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N377 158 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 XP32Q5T750 250 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A20O43772 301 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1G1O75348 118 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00483Q53H64 154 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf86A6NJI1 115 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS29P62273 56 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE2CQ5TA81 110 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR1AP35321 89 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ1DNQ9H478 68 aa15.14■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 S100PP25815 95 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 BAGE3Q86Y29 109 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A096LNJ9 63 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CFC1BP0CG36 223 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM13P0DJ93 91 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A12P80511 92 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.1■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1HP80294 61 aa15.09■□□□□ 0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-217ENST00000629983 HBDP02042 147 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-217ENST00000629983 PMCHL1Q16048 86 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-217ENST00000629983 ERC2-IT1O76042 136 aa15.06■□□□□ 0
CAPNS1-217ENST00000629983 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.06■□□□□ 0
CAPNS1-217ENST00000629983 COX19Q49B96 90 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf153Q5TBE3 101 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-217ENST00000629983 B5MCH6 92 aa15.04■□□□□ -0
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa15.03■□□□□ -0
CAPNS1-217ENST00000629983 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00614P0C842 121 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PCOTHQ58A44 107 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM223A0PJW6 202 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC11CQ9BY50 192 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9BRP9 147 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DDTP30046 118 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HERV-K104P63124 156 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00587B1AMM8 73 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZRX8 168 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM218A2RU14 115 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf92A6NGG3 77 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LORP23490 312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2T5 61 aa14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCC3Q6UW78 93 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMD2Q9BT23 127 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CLLU1Q5K131 121 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-217ENST00000629983 COX6B2Q6YFQ2 88 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV6-57P01721 117 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RHEBQ15382 184 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD7Q86VX2 200 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y8G0 127 aa14.72□□□□□ -0.05
CAPNS1-217ENST00000629983 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms