RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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GLIS1-202ENST00000628545 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.98□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 SYCNQ0VAF6 134 aa11.98□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.98□□□□□ -0.49
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GLIS1-202ENST00000628545 IGKV4-1P06312 121 aa11.97□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 PLA2G2AP14555 144 aa11.97□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.96□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01006Q8NI28 216 aa11.96□□□□□ -0.49
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GLIS1-202ENST00000628545 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
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GLIS1-202ENST00000628545 C10orf25Q5T742 122 aa11.82□□□□□ -0.52
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GLIS1-202ENST00000628545 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.8□□□□□ -0.52
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GLIS1-202ENST00000628545 NDUFS5O43920 106 aa11.8□□□□□ -0.52
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GLIS1-202ENST00000628545 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.78□□□□□ -0.52
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GLIS1-202ENST00000628545 ZANQ9Y493 2812 aa11.78□□□□□ -0.52
GLIS1-202ENST00000628545 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.78□□□□□ -0.52
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GLIS1-202ENST00000628545 A0A096LPF7 62 aa11.75□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 GYPEP15421 78 aa11.75□□□□□ -0.53
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GLIS1-202ENST00000628545 B4DSR2 109 aa11.73□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 LCA10Q71F78 164 aa11.73□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.73□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 PDZD2O15018 2839 aa11.72□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.72□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.72□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB130BP0DP73 79 aa11.71□□□□□ -0.53
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB130AP0DP74 79 aa11.71□□□□□ -0.53
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