RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.02□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BS24 57 aa6.02□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZRP5 223 aa6.02□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.02□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GU69 56 aa6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00313P59037 77 aa6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.01□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM29Q86T20 159 aa6□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 Q96NJ1 140 aa6□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00846Q9NV44 126 aa6□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.99□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.99□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.99□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 ACYP2P14621 99 aa5.98□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.98□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 EPM2AB3EWF7 344 aa5.97□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8NBF4 154 aa5.97□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.96□□□□□ -1.45
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.96□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.96□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.95□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.95□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.94□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.94□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BNG1 76 aa5.94□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.94□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 COL4A2P08572 1712 aa5.93□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 LCA10Q71F78 164 aa5.93□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.93□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.93□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MUN3 132 aa5.92□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.92□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A096LNJ9 63 aa5.92□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 WIPF1O43516 503 aa5.92□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 BCE1O60756 84 aa5.91□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZRX8 168 aa5.91□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.9□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.9□□□□□ -1.46
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8NAQ8 132 aa5.9□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 PRO0461Q9UI25 63 aa5.9□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf92A6NGG3 77 aa5.89□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 LRRK2Q5S007 2527 aa5.89□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM168BA1KXE4 195 aa5.89□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.88□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.87□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.87□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.87□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.87□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 JMJD1CQ15652 2540 aa5.86□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 APLNQ9ULZ1 77 aa5.85□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.85□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.85□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.84□□□□□ -1.47
CYFIP1-208ENST00000617928 UTRNP46939 3433 aa5.84□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EIL1 84 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 DSCR10P59022 87 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP10-11P60412 298 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZQT0 140 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.83□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.82□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.82□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.82□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRBP23467 1997 aa5.82□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.82□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 CENPFP49454 3210 aa5.81□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GW54 56 aa5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 PCNTO95613 3336 aa5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BPC8 53 aa5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV6-57P01721 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01546A6NGU7 62 aa5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MWP4 228 aa5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR15Q8IV56 129 aa5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.78□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.78□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01600Q96MT4 127 aa5.78□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01554Q52M75 96 aa5.78□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.78□□□□□ -1.48
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.77□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WTM6 91 aa5.76□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EQZ3 153 aa5.76□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms