RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592194.1

PRKAR1A-220, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-220ENST00000592194 CXCL5P42830 114 aa8.48□□□□□ -1.05
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PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.48□□□□□ -1.05
PRKAR1A-220ENST00000592194 C7orf33Q8WU49 177 aa8.48□□□□□ -1.05
PRKAR1A-220ENST00000592194 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PRKAR1A-220ENST00000592194 PLNP26678 52 aa8.47□□□□□ -1.05
PRKAR1A-220ENST00000592194 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.47□□□□□ -1.05
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PRKAR1A-220ENST00000592194 PET117Q6UWS5 81 aa8.45□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 S100A6P06703 90 aa8.44□□□□□ -1.06
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PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.44□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.44□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 PFN2P35080 140 aa8.43□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 ATOH7Q8N100 152 aa8.43□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 LRP2P98164 4655 aa8.43□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 C5orf52A6NGY3 159 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 LEPROTO15243 131 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 S100A2P29034 98 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP10-8P60410 259 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 ERG28Q9UKR5 140 aa8.42□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 A0A0U1RRA0 63 aa8.41□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.41□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.41□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.4□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 J3QQQ9 107 aa8.4□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 HERVK_113P61574 105 aa8.4□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.4□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 Q8NDZ9 215 aa8.4□□□□□ -1.06
PRKAR1A-220ENST00000592194 E9PLD3 99 aa8.39□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.39□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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PRKAR1A-220ENST00000592194 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.38□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 M0QXV9 152 aa8.37□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 C20orf202A1L168 122 aa8.36□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC00158P58513 81 aa8.36□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.36□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.35□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 DAND5Q8N907 189 aa8.35□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 HERV-K104P63124 156 aa8.34□□□□□ -1.07
PRKAR1A-220ENST00000592194 COX17Q14061 63 aa8.34□□□□□ -1.07
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PRKAR1A-220ENST00000592194 GAGE10A6NGK3 116 aa8.32□□□□□ -1.08
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PRKAR1A-220ENST00000592194 NMUP48645 174 aa8.32□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.32□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 PCP2Q8IVA1 136 aa8.31□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 ZNF815PA8K554 130 aa8.3□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.3□□□□□ -1.08
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PRKAR1A-220ENST00000592194 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.3□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.29□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 SCGB1D1O95968 90 aa8.29□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 NPC2P61916 151 aa8.29□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 UBE2BP63146 152 aa8.29□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC00167Q96N53 147 aa8.29□□□□□ -1.08
PRKAR1A-220ENST00000592194 C1orf137Q5JT78 98 aa8.28□□□□□ -1.08
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PRKAR1A-220ENST00000592194 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.25□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 IGKV2D-28P01615 120 aa8.25□□□□□ -1.09
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PRKAR1A-220ENST00000592194 IGLV7-43P04211 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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PRKAR1A-220ENST00000592194 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.22□□□□□ -1.09
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PRKAR1A-220ENST00000592194 TIMM17BO60830 172 aa8.22□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 AKR1D1P51857 326 aa8.22□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.22□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 RNF213Q63HN8 5207 aa8.22□□□□□ -1.09
PRKAR1A-220ENST00000592194 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.21□□□□□ -1.1
PRKAR1A-220ENST00000592194 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.21□□□□□ -1.1
PRKAR1A-220ENST00000592194 PYY3Q5JQD4 70 aa8.21□□□□□ -1.1
PRKAR1A-220ENST00000592194 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.21□□□□□ -1.1
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.21□□□□□ -1.1
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