RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE10A6NGK3 116 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL5P42830 114 aa14.96□□□□□ -0.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.93□□□□□ -0.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM17AQ99595 171 aa14.92□□□□□ -0.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.65□□□□□ -0.06
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CAPNS1-211ENST00000590874 DAND5Q8N907 189 aa14.5□□□□□ -0.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTA2Q6UW10 78 aa14.46□□□□□ -0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PLD3 99 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00158P58513 81 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM223A0PJW6 202 aa14.44□□□□□ -0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PRO1933Q9H354 126 aa14.44□□□□□ -0.1
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