RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.47□□□□□ -0.73
CTIF-205ENST00000587860 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.47□□□□□ -0.73
CTIF-205ENST00000587860 COL6A5A8TX70 2615 aa10.46□□□□□ -0.73
CTIF-205ENST00000587860 LINC00158P58513 81 aa10.46□□□□□ -0.73
CTIF-205ENST00000587860 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.46□□□□□ -0.73
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CTIF-205ENST00000587860 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTIF-205ENST00000587860 CELA1Q9UNI1 258 aa10.44□□□□□ -0.74
CTIF-205ENST00000587860 Q6JHZ5 121 aa10.44□□□□□ -0.74
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CTIF-205ENST00000587860 SNURFQ9Y675 71 aa10.44□□□□□ -0.74
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CTIF-205ENST00000587860 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.22□□□□□ -0.77
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.15□□□□□ -0.78
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CTIF-205ENST00000587860 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.14□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.13□□□□□ -0.79
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