RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	HERVK_113	P61574	105 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	C22orf24	Q9Y442	160 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668		E9PLD3	99 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	PFN2	P35080	140 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-223	ENST00000561668	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668		J3QQQ9	107 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	NMU	P48645	174 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	DIRC1	Q969H9	104 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00587	B1AMM8	73 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	KRTDAP	P60985	99 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	SMIM13	P0DJ93	91 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	VPREB1	P12018	145 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00158	P58513	81 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-223	ENST00000561668	AKR1D1	P51857	326 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	C5orf52	A6NGY3	159 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	S100A6	P06703	90 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00167	Q96N53	147 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	C20orf202	A1L168	122 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP10-8	P60410	259 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668		Q8NDZ9	215 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668		H0Y9J4	135 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	S100A2	P29034	98 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668		A0A0J9YXY3	114 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668		A0A0U1RRA0	63 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF861P	O60384	105 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	BCE1	O60756	84 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	TIMM17B	O60830	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	LITAF	Q99732	161 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668		M0R378	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-223	ENST00000561668	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2D-28	P01615	120 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	DAND5	Q8N907	189 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	NDUFC2	O95298	119 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	UBE2A	P49459	152 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM126A	Q9H061	195 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-223	ENST00000561668	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	TNXB	P22105	4242 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	SPRR1A	P35321	89 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM238	C9JI98	176 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	SPANXC	Q9NY87	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	PRY	O14603	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	NCR3	O14931	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZVH6	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	SCGB1D1	O95968	90 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV6-57	P01721	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-223	ENST00000561668	CRYGA	P11844	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	S100A12	P80511	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	PRLH	P81277	87 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	IFITM1	P13164	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	DDT	P30046	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	NPC2	P61916	151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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