RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560676.5

AKAP13-222, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene AKAP13, Length 3,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-222	ENST00000560676	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676		A0A096LPF7	62 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	REG3A	Q06141	175 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676		X6R8D5	127 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AKAP13-222	ENST00000560676	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	GHRH	P01286	108 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	HILS1	P60008	231 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	SEC61G	P60059	68 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	TENM3	Q9P273	2699 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		H3BQ85	93 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		Q6ZQT0	140 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		Q8NDZ9	215 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	BCE1	O60756	84 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	PDE6G	P18545	87 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		A0A0J9YWU9	116 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		Q8N3U1	123 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	DAD1	P61803	113 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676		Q5XG85	94 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-222	ENST00000560676	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676		Q6ZQY7	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	MDFI	Q99750	246 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	LELP1	Q5T871	98 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	DEFB4A	O15263	64 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	HAMP	P81172	84 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676		Q6ZVQ6	151 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	OXT	P01178	125 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	APOC4	P55056	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	CXCL6	P80162	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676		M0R2N4	97 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	MIF	P14174	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	COX7B	P24311	80 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	HTN3	P15516	51 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676		Q8NAQ8	132 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676		H7BZZ5	65 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-222	ENST00000560676		V9GYY9	64 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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