RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 A0A0U1RRA0 63 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 IGKV2D-28P01615 120 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 LINC00158P58513 81 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BKO60814 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BJP06899 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 SMIM13P0DJ93 91 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BOP23527 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BBP33778 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BDP58876 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BCP62807 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 RPL24P83731 157 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 TMEM238C9JI98 176 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 PLNP26678 52 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 DPM2O94777 84 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 LEPROTO15243 131 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 HERV-K104P63124 156 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 M0R378 163 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 TMEM126AQ9H061 195 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 IGKCP01834 107 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 UBE2AP49459 152 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-222ENST00000550996 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 A0A087X002 238 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 J3QQQ9 107 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 PRLHP81277 87 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 ANAPC11Q9NYG5 84 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 LPAP08519 4548 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 DAND5Q8N907 189 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 ATP6V1G1O75348 118 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 HERVK_113P61574 105 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 NCR3O14931 201 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-222ENST00000550996 LINC00587B1AMM8 73 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 NMUP48645 174 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 E9PLD3 99 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 LINC01545Q5VT33 79 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 CRYGAP11844 174 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-222ENST00000550996 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 RNF213Q63HN8 5207 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 A0A0J9YXY3 114 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 C3orf79P0CE67 100 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 SPRR1AP35321 89 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 PET117Q6UWS5 81 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 PRYO14603 147 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 LITAFQ99732 161 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-222ENST00000550996 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 TSPAN13O95857 204 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 KRTDAPP60985 99 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 NPC2P61916 151 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 DDTP30046 118 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 SPRR4Q96PI1 79 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 MIEN1Q9BRT3 115 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 NDUFC2O95298 119 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 IGLV6-57P01721 117 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-222ENST00000550996 ZNF815PA8K554 130 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 B5MCH6 92 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 PRR4Q16378 134 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 TIMM17BO60830 172 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-222ENST00000550996 ERC2-IT1O76042 136 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.7 ms