RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	SYNM	O15061	1565 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MYOM1	P52179	1685 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RICTOR	Q6R327	1708 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PREX2	Q70Z35	1606 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MED23	Q9ULK4	1368 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		E7EQ34	232 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	S100A5	P33763	92 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	EDDM3B	P56851	147 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		Q6AWC8	147 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	BAGE3	Q86Y29	109 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MYH3	P11055	1940 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SHPRH	Q149N8	1683 aa		-0.91	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NWD1	Q149M9	1564 aa		-0.91	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		-0.91	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		-0.91	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		-0.91	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SIX6	O95475	246 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R17	O96001	155 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SCGB1A1	P11684	91 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	LINC00158	P58513	81 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	PLGLB1	Q02325	96 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	WT1-AS	Q06250	92 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	COX17	Q14061	63 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TRIQK	Q629K1	86 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	C5	P01031	1676 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1B0GX51	115 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	OR8B8	Q15620	311 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TRGV9	Q99603	122 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ERG28	Q9UKR5	140 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	MYH8	P13535	1937 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	UACA	Q9BZF9	1416 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	MYH1	P12882	1939 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ROCK1	Q13464	1354 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204		A0A0G2JND7	137 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1B0GU69	56 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFC1	O43677	76 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TCRA	P04437	139 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ACYP1	P07311	99 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	PIRT	P0C851	137 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	COX7B	P24311	80 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SEC11A	P67812	179 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	NMS	Q5H8A3	153 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	C10orf82	Q8WW14	230 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SAMD9	Q5K651	1589 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	SCRIB	Q14160	1630 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	MADD	Q8WXG6	1647 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	PPL	O60437	1756 aa		-0.93	□□□□□ -2.56
MDM2-233	ENST00000545204	NFAT5	O94916	1531 aa		-0.94	□□□□□ -2.56

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