RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 C2orf82Q6UX34 121 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 TIMM17AQ99595 171 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 COX7CP15954 63 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM141Q96I45 108 aa8.41□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.4□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 PSCAO43653 123 aa8.4□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 AMELXQ99217 191 aa8.4□□□□□ -1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.39□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.39□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.38□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 C11orf86A6NJI1 115 aa8.38□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 CXCL5P42830 114 aa8.38□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.38□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIAP1O43715 76 aa8.37□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM258P61165 79 aa8.37□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00643Q86TS7 51 aa8.37□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 C2orf48Q96LS8 159 aa8.37□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP10-2P60368 255 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 SS18Q15532 418 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 Q1RN00 199 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 LECT2O14960 151 aa8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 H7C2G1 150 aa8.35□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N814 137 aa8.35□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM223A0PJW6 202 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 J3QQQ9 107 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 XCL1P47992 114 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 C5orf38Q86SI9 138 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 DPH3Q96FX2 82 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 USP17L23D6RBM5 183 aa8.34□□□□□ -1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 ATOX1O00244 68 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 LST1O00453 97 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 TRACP01848 142 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 20.9
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 Q5XG85 94 aa8.33□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 PKHD1P08F94 4074 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 F8WDY8 70 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 COX6CP09669 75 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 C15orf56Q8N910 161 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.32□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.31□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 COX6A2Q02221 97 aa8.31□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 hADV29S1A0JD25 119 aa8.3□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 LEPROTO15243 131 aa8.3□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 C4orf26Q17RF5 130 aa8.3□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 OXTP01178 125 aa8.3□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 C14orf177Q52M58 125 aa8.3□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 COX7A2LO14548 114 aa8.29□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.29□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0J9YXV3 536 aa8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 SLPIP03973 132 aa8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.28□□□□□ -1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.27□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.27□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.27□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A087WZ39 114 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MALP21145 153 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 PRO0628Q9UI54 55 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 C16orf90A8MZG2 172 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CLEC2BQ92478 149 aa8.26□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 DAND5Q8N907 189 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 DSCR8Q96T75 97 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 LITAFQ99732 161 aa8.25□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0J9YXY3 114 aa8.24□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP10-1P60331 282 aa8.24□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 SERP2Q8N6R1 65 aa8.24□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.24□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KIAA0087Q14695 138 aa8.22□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.22□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.22□□□□□ -1.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.2□□□□□ -1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 SPAG11BQ08648 103 aa8.2□□□□□ -1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms