RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9UF83 564 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.93□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WVE0 104 aa11.93□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA0087Q14695 138 aa11.91□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GW54 56 aa11.9□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC179H3BU77 68 aa11.9□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00846Q9NV44 126 aa11.9□□□□□ -0.5
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.9□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 HCG22E2RYF7 251 aa11.89□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 C16orf90A8MZG2 172 aa11.88□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 CXCL6P80162 114 aa11.88□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.88□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 RTL8CO15255 209 aa11.88□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 SVIPQ8NHG7 77 aa11.87□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.86□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 A6NED7 52 aa11.85□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.85□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.85□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZRP5 223 aa11.84□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 H0Y9P7 68 aa11.84□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.84□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZRX8 168 aa11.84□□□□□ -0.51
PTDSS1-202ENST00000517309 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.83□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM229AH3BQW9 127 aa11.83□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 MOBPQ13875 183 aa11.82□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.82□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CRYGAP11844 174 aa11.8□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.8□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EIL1 84 aa11.79□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PCOTHQ58A44 107 aa11.78□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.78□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 hDV103S1A0JD37 113 aa11.78□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8NBF4 154 aa11.77□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.77□□□□□ -0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.76□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 EPM2AB3EWF7 344 aa11.76□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP10-11P60412 298 aa11.75□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.75□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 BCE1O60756 84 aa11.75□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.74□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.72□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.72□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 VPREB1P12018 145 aa11.71□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.71□□□□□ -0.53
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.71□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.71□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.7□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP10-3P60369 221 aa11.7□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.7□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 CDIP1Q9H305 208 aa11.7□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR34Q9NV39 138 aa11.7□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV6-57P01721 117 aa11.68□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZQT0 140 aa11.68□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 CHTF8P0CG12 524 aa11.68□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 LITAFQ99732 161 aa11.68□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 USP24Q9UPU5 2620 aa11.67□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.67□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2-30P06310 120 aa11.67□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SMIM29Q86T20 159 aa11.66□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SPINK1P00995 79 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PRO0461Q9UI25 63 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0U1RQV1 116 aa11.64□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.64□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.63□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.62□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.61□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.61□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 H3BPC8 53 aa11.6□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00313P59037 77 aa11.59□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.57□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM168BA1KXE4 195 aa11.57□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 C15orf56Q8N910 161 aa11.56□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 C7orf65Q6ZTY9 151 aa11.54□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.54□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WTM6 91 aa11.53□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.53□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.53□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 C8orf87E5RJ46 101 aa11.53□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 ACYP2P14621 99 aa11.52□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.52□□□□□ -0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.52□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.51□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MAST4O15021 2626 aa11.49□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.49□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF861PO60384 105 aa11.48□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ITPR3Q14573 2671 aa11.48□□□□□ -0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 A8MWP4 228 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms