RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 RNF213Q63HN8 5207 aa5.04□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.04□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 UQCRQO14949 82 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM243Q9BU79 118 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 RETNQ9HD89 108 aa5.03□□□□□ -1.6
SMIM20-202ENST00000514384 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 NACAE9PAV3 2078 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1B0GX51 115 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 CRPP02741 224 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 MALP21145 153 aa5.02□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00694P0DN24 101 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 HTN1P15515 57 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 NPC2P61916 151 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 Q6JHZ5 121 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 COX7B2Q8TF08 81 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.01□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 ATOX1O00244 68 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 CRYGAP11844 174 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 COX7CP15954 63 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 C16orf74Q96GX8 76 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 FAM218AQ96MZ4 157 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00167Q96N53 147 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 A0A087WZ39 114 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 UBE2L6O14933 153 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 IGKV2D-28P01615 120 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 STHQ8IWL8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.99□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 DNAL4O96015 105 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 PRM2P04554 102 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 C2orf48Q96LS8 159 aa4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 CCL18P55774 89 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB136Q30KP8 78 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 Q6ZTI0 123 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 XCL2Q9UBD3 114 aa4.97□□□□□ -1.61
SMIM20-202ENST00000514384 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 BCE1O60756 84 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 CDK2AP2O75956 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 NDUFC2O95298 119 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.96□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1B0GUV1 79 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 Q8IZM0 81 aa4.95□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 A0A087WYN8 130 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 A0A0U1RRA0 63 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 F8WDY8 70 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 H3BQ85 93 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 J3KT08 172 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 CCKP06307 115 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00158P58513 81 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 COX17Q14061 63 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 FHL2Q14192 279 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 SERP2Q8N6R1 65 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.94□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.93□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 CCL24O00175 119 aa4.93□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 RTL8CO15255 209 aa4.93□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM258P61165 79 aa4.93□□□□□ -1.62
SMIM20-202ENST00000514384 Q9HAA7 133 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms