RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	SAMD9	Q5K651	1589 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	COX8A	P10176	69 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	CHD6	Q8TD26	2715 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	NEB	P20929	6669 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	ABCC3	O15438	1527 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	PEA15	Q15121	130 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	HMGN3	Q15651	99 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188		V9GYS6	101 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	CEP162	Q5TB80	1403 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	KIF14	Q15058	1648 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RNF146-208	ENST00000495188	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	IGLC2	P0DOY2	106 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	IGLC3	P0DOY3	106 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SPTA1	P02549	2419 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188		I3L3M4	83 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PRM1	P04553	51 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SMIM11A	P58511	58 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188		K7EP34	96 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SPINK4	O60575	86 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	C4A	P0C0L4	1744 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	C4B	P0C0L5	1744 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	CYB5A	P00167	134 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	NMS	Q5H8A3	153 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PYY3	Q5JQD4	70 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.06	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		0.05	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	GNG2	P59768	71 aa		0.05	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PLGLA	Q15195	96 aa		0.05	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		0.05	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SSPO	A2VEC9	5147 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	0.04	□□□□□ -2.4	4e-8	■■■■■ 30.4
RNF146-208	ENST00000495188	ATR	Q13535	2644 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	ATP7B	P35670	1465 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	RGPD5	Q99666	1765 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	APC2	O95996	2303 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1B0GUT8	65 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	SPRR2D	P22532	72 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	LELP1	Q5T871	98 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RNF146-208	ENST00000495188	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	PIK3C2B	O00750	1634 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	FLNC	Q14315	2725 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	MUC2	Q02817	5179 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	COX7B	P24311	80 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	TDRG1	Q3Y452	100 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	GAFA1	Q96PS6	74 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	TNXB	P22105	4242 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	DIP2B	Q9P265	1576 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	NES	P48681	1621 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CCL22	O00626	93 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	LINC00643	Q86TS7	51 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		0.01	□□□□□ -2.41

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